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上调基因和下调基因
什么是
基因
的
上调和下调
答:
基因的
上调和下调
是指基因表达过程中的两种不同调控状态。基因表达是生物体内的重要过程,涉及到DNA中的遗传信息被转化为功能性蛋白质的过程。在这个过程中,基因的表达水平可能会发生变化,其中最常见的表现就是基因的上调和下调。具体来说:
基因上调
是指基因表达水平上升的过程。在特定条件下,如外部环境...
什么是
基因
的
上调和下调
答:
上调
就是
基因
转录成mRNA时受到正向调控,促进表达。
下调
是受到抑制,表达量减少。在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录(transcription)。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链(template strand)或反义链(antisense strand)。而不作为转录模板的链称为编码链(coding strand)或...
为什么
上调基因和下调基因
分开分析
答:
上调
就是
基因
转录成mRNA时受到正向调控,促进表达.
下调
是受到抑制,表达量减少.
基因
表达调控中说的
上调和下调
是什么意思?
答:
调控结果使
基因
表达水平提高的称为正性调控
(上调)
,使基因表达水平降低者为负性调控
(下调
)
在生物学中,一个
基因上调
一个
基因下调
是什么关系
答:
一个
基因上调
一个
基因下调
是什么关系 简单的说,基因组是一个物种全部基因的集合体。基因组,是指一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列,包括全套
基因和
间隔序列。可是基因组测序的结果发现基因编码序列只占整个基因组序列的很小一部分。因此,基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码...
什么是下游
基因
答:
下游
基因
,downstream就是下游的意思,upstream是上游的意思。一段完整的基因一般包括几个结构区,启动子,增强子,编码区,非编码区等。一般,起始密码子之前的成为上游基因,之后的成为下游基因。下游基因含有增强子原件,所以也会调节基因的表达。上有基因中包含启动子操纵子之类的所以也会调控目的基因的表达...
GEO数据分析——KEGG
基因
通路富集
答:
在分析阶段,我们分别对
上调和下调基因
执行富集分析,设定显著性阈值为0.9。然后,我们将结果可视化,通过kegg_plot函数将上调和下调基因的富集路径以条形图的形式呈现,颜色区分上调(红色)和下调(蓝色)基因,以直观地展示各通路的差异性。通过KEGG的深入分析,我们不仅能够揭示基因表达差异背后的生物学...
转录组
上调基因和下调基因
怎么看
答:
只有做实验才能确定到底是
上调
还是
下调
。现有关于protein-DNA interaction的public数据库基本没有direction信息。商业数据库像MetaCore和IPA还是好用很多。如果有特定的TF要看,可以去GEO看看有没有这个TF mutant 或者knock-out的数据。如果有的话,至少能多点信息帮助判断,不过要注意物种或条件差异。
绘制差异
基因
kegg注释图
答:
接下来,需要添加一列,将“regulated”中的“up”标记为“red”,“down”标记为“green”。这样,在生成的KEGG注释图中,
上调基因
将显示为红色,
下调基因
显示为绿色。具体操作是在第三列插入一个“if”函数,当第二列值为“up”时输出“red”,否则输出“green”。参数设置如下:完成后,C2单元格将...
上调
甲基化位点
和下调
甲基化位点区别
答:
1、表达量不同,
上调
甲基化位点就是
基因
转录成mRNA时受到正向调控,促进。
下调
甲基化位点是受到抑制,表达量减少。2、变化倍数的区域不同,上调的甲基化位点在5UTR区的最高,下调的甲基化位点在CDS区的变化倍数最高。
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