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基因测序罗氏诊断
【临检杂谈】---临床检测,到底该选PCR还是NGS?(二)
答:
通过前一章的介绍,可能大家都注意到了,我在提及
测序
的时候,就已经提到了两家公司,
罗氏
,和Illumina。那么,我就从这两家公司的发展历程为切入点,探究资本在临床检测市场上发挥的作用。测序巨头 Illumina 在2000年前后,经济发达的美国,随着人类
基因
组计划步入尾声,大家对基因的了解越来越深入,股市...
基因测序
的发展前景
答:
根据
罗氏
和基础医学签署的协议,罗氏可以访问基础医学的数据库。他们的数据库收录了3.5万名癌症患者的肿瘤DNA序列,以及这些患者服用的药物和药物在遏制癌症方面产生的功效等信息。
DNA测序
以及其他生物学信息技术正在改变这一切。肿瘤
基因测序
技术揭示出所说的“肾癌”或者“肺癌”的真相。从某种程度上说,...
罗氏
454
测序
系统的介绍
答:
罗氏
454
测序
系统是454 生命科学公司推出的 454测序技术,是基于焦磷酸测序法的超高通量
基因
组测序系统, 开创了第二代测序技术的先河。该技术是通过合成反应而测序(Seqencing-bysynthesis, SBS)的原理进行测序的。
香港
基因
检测的化验所正规吗?
答:
这个不能保证香港所有
基因检测
的化验所都正规,但达雅高肯定是正规的大化验所。其与香港裕力检测中心是官方指定合作伙伴。检测结果准确可靠,值得信赖。
罗氏
454
测序
系统的测序流程
答:
1. 样品种类:GS FLX系统支持各种不同来源的样品序列测定,包括
基因
组
DNA
,PCR产物,BACs,cDNA及小分子RNA等,不同类型的样品
测序
都可在一台仪器上完成。2. 样品DNA打断:样品如基因组DNA或BAC等被打断成300到800bp的片段;对于小分子的非编码RNA,这一步骤并不需要。短的PCR产物则可利用GS融合引物...
罗氏
454
测序
系统的应用
答:
利用454
测序
系统测序植物转录组,可以得到大量的表达序列标签(Expressedsequencetag,EST)。EST是cDNA的一个片段,通常长度在150~400bp之间。研究人员可以通过连接两端有相同序列的EST,获得一个contig,直至全长cDNA序列。通过对这些EST序列与已知数据库进行生物信息学分析比较,可以进行如下研究。 1新
基因
发现与...
基因
组
测序
为什么会出现GAP
答:
目前二代
测序
读长(reads)有限,最长的是
罗氏
454,现在据说能有400bp吧,illumina测序和其他测序就只能有150bp,现在测序又是将
基因
组打断后测序,但仍然可能测得的读长可能不够长,导致一部分信息丢失,于是产生gap,这个只要根据其上下游已测得的序列信息进行引物设计,再用一代测序补gap即可。
基因测序
中的gap是什么意思
答:
二代
测序
的读长比较短,一般的仪器大概150bp,最高也就400bp(
罗氏
454),所以遇到大片段样本需要测序时,就有可能出现片段打碎后,有一部分片段没有重叠,那么测序出来的结果就无法拼接,中间有一段gap得不到数据,因此也影响了它的准确率
基因
芯片是属于第一代
测序
技术还是第二代测序技术
答:
基因
芯片不属于
测序
技术,属于测序技术的平台目前有:第一代:Sanger测序仪(3730XL),毛细管电泳测序仪等;第二代:Illumina测序平台、ion PGM/Proton测序平台、CG测序平台、
罗氏
454测序平台、SOLID测序平台等;第三代:PacBio测序平台等。
基因
组高通量
测序
的原理
答:
测序
反应采用BigDyeTerminatorchemistryversion3.1(AppliedBiosystems)和标准M13或常用正向引物和反向引物。测序反应通过BiomekFX(Beckman)移液操作工作站建立。机械臂负责等分模板试样,起与反应液混合的作用,反应液含有双脱氧核苷酸、荧光标记的核苷酸、Taq
DNA
聚合酶、序列引物和缓冲液。模板和反应板有条形码,且...
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