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转录组测序多少个g
转录组
数据量
12g和6g
的差异
答:
一般来说,
12G的测序数据会比6G的数据更丰富
,有更多的数据可以用来分析RNA表达水平,进行差异分析等。此外,如果将每个样本的数据量配平,则12G的数据量通常可以提供更高的测序覆盖度,也就是说,同样的样本的RNA转录本测序覆盖数量会更高,因此更能反映样本的RNA表达水平。然而,样本数量和具体研究问题也...
转录组测序
费用大概
多少
啊
答:
你好,
基因组如果在2G以内,转录组测序一个样品一般测2-4G数据量
,如果基因组大,可以适当增加数据量,现在测序的价格很便宜,又到了年底,搞活动的公司很多,一般4G的数据量2万左右比较合适。关键看好公司是不是有分析能力,售后怎么样。
水稻
转录组测序
需要
多少
数据
答:
根据你的测序需要,如果是仅仅检测表达,可以使用单端的短序列测序,
一般10M以上reads都满足要求
,如果是还要检测SNP或可变剪切以及新基因之类的话需要使用更长片段的双端测序,一般2x100以上或者2x125,数据量大概在2-3G以上,当然越多越好。还要同等预算下建议增加重复数,比增加数据量更加有效也更有意义 ...
宏
转录组
一般推荐
多少测序
深度?
答:
普通环境样本,测序深度默认为8G
,寄生或肠道微生物,推荐10G数据量,建议根据研究目的来选择数据量。
转录组测序
之各类样品如何取样
答:
3. 细胞样品 :
转录组测序
中,细胞一定要达到足够的数量,以保证抽提的RNA的量。所以对于培养的细胞系,首先要确定细胞数量(建议5×10^6以上)。首先对收集好的细胞用1×PBS清洗几遍,贴壁培养的先用少量胰酶消化一下(切记不要消化过度),离心,弃PBS,加入适量的Trizol裂解液并反复吹打混匀,直至...
二代
测序
中barcodes index的介绍
答:
以转录组来说,一个样品测序量不会超过4G,一个lane可以同时测定10个转录组样品。大体而言,外显子组测序、
转录组测序
、miRNA测序、lncRNA测序、ChIP测序等组数据,每个样品所需的数据量通常都比较少。测序数据的单位 核酸序列数据是以“A、T、G、C”碱基顺序表示,而其数量的大小可以使用k、M、G等...
单细胞
转录组测序
基因表达量分析 需要
多少测序
量
答:
转录组测序
是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。转录组测序和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的...
转录组测序
(RNA-seq)详细建库步骤与原理
答:
转录组测序
(RNA-seq)的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先,根据研究目标选择合适的策略,如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA,而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性,有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下:总RNA提取:检查纯度、浓度和完整性...
正常的
转录组测序
包含小rna吗
答:
转录组测序
的方法很多,而RNA-seq是当前转录组测序的一种测序方法,又称为二代测序,包括454,solexa等。RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等或者其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来。反映出它们的表达水平。样品要求:⑴样品纯度要求: total RNA OD值应在1.8...
植物有参基因组
转录组测序
测序量要多大
答:
转录组
是连接基因组遗传信息与生物功能的必然纽带,转录组研究已经成为揭示生物生长发育调控和逆境胁迫适应机制、生物进化规律、疾病发生发展的重要机制以及发现致病基因调控的关键靶点等方面的最佳研究手段。近年来,随着
测序
成本的不断降低和测序通量的飞跃提升,第二代测序技术凭借高准确性、高通量、高灵敏度...
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