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16sRNA测序的样本最好是多少
16sRNA
为何为谱系的分子尺度
答:
16S大小合适,
1540bp
,方便测序又包含足够信息量,它有高度保守的区域,中度特化和高度特化的区域可以适应不同分类单元的分类,这些变化是时间积累的结果,相当于进化的分子钟。16S完全一样的菌,不一定是同一个种,还需要通过生理生化指标进一步确定。如果有价值,那就全基因组测序吧!
PCR扩增
16sRNA
怎么扩?
答:
99%的微生物菌种鉴定,都是扩增rDNA
测序
,从来没有听说什么扩RNA的,RNA那么不稳定,还能经得起PCR那么折腾?要扩增RNA的信息,也得先把RNA反转录成cDNA才能PCR。然后,那东西叫做:16s rDNA,意思是,16s那么大的一个核糖体DNA亚基,你一定是看错了,那个“r”的意思是核糖体,不是RNA。。。总之,你...
宏基组
测序
有没有深度概念
答:
宏基因组的目的是检测
样品
的菌群种类、风度等信息。在做测序前,可能根本不知道目的菌群的特征。宏基因组通过测
16sRNA
来区分不同菌群。通过对16sRNA计数,来估计菌群的丰度。这个有点类似转录组测表达量了。菌群丰度较高的菌种测的就会比较多,丰度低的测的就少。这样,宏基因组没有
测序的
层数概念。有...
求高人指教,
16sRNA测序
问题,
答:
先回顾一下
16sRNA测序的
发展历程,然后介绍一下是如何测序的,也就是具体步骤,展望一下再。基本就这流程,再看看楼下怎么说吧,综合一下。
细菌鉴定中到底是16srDNA
测序
还是16srRNA测序?
答:
细菌鉴定中
测序
测的是16S rDNA基因,因为RNA是不稳定的。16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的“分子钟”,素有“细菌化石”之称。16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与...
细菌鉴定中到底是16srDNA
测序
还是16srRNA测序?
答:
测序
测的是16S rRNA基因而不是16S rRNA,即编码16S rRNA的DNA序列,所以说其实是16S rDNA测序,而且RNA还特别容易降解 来自:求助得到的回答 本回答由网友推荐 举报| 评论(1) 25 2 tchzf33 采纳率:31% 擅长: 生物学 MP4/MP3 其他回答
16sRNA
Helen19891016 | 发布于2012-12-06 举报| 评论 0 3 16s...
基因芯片与SNP技术区别
答:
一、原理不同 1、SNP技术:首先,用聚合酶链反应(PCR)扩增含单核苷酸多态性的基因组片段,然后用序列特异性引物进行单碱基扩增。然后将
样品
分析物与芯片基体共结晶,在真空管中用瞬时纳秒(10-9s)激光进行激发。2、基因芯片:
测序
原理是杂交测序法,即用已知序列的一组核酸探针杂交的核酸测序法。二、...
女性菌能益生菌能与肠道益生菌同服吗
答:
研究者使用野生棘鱼及实验室条件下培养的棘鱼、实验室条件培养的小鼠和人类的肠道微生物为
样本
,通过对其
16sRNA
进行
测序
分析,鉴定和测定了其中微生物菌群的种类和数量。在得到这些样本的数据后,研究者使用针对性的显著性分析方法分析比对。结果发现,饮食变化对肠道微生物菌群的影响效果因性别不同而具有显著...
PCR鉴定微生物,请问一下具体的步骤是什么?
答:
通过PCR可以鉴定到种 具体步骤:1将培养过的微生物(
最好是
青年时代的)提取基因组(这步不清楚再问我)2 通过PCR扩增,3 测定基因序列 4 和已知的基因图库上的序列比较,就可以确定是哪一个种 不过现在一般不采用基因组来比较,这样工程量太大。比较
16SRNA
是比较常用的方法。相对简单,准确度高。
16sRNA的
一些问题
答:
PCR产物直接
测序是
用PCR引物进行测序,而测序两端引物结合位点会有几十个碱基读不出来.这个是目前技术问题,所有公司的测序仪器都读不出来.而TA克隆之后就是用载体的通用引物测序,因为载体的序列是知道的,所以即使两端有一部分读不清 也没有关系,这样两个反应就可以测通拼接得到全长序列了.
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