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16s测序结果不好
细菌如何提取
16s
rDNA(用来做种类鉴定的)
答:
- - 还是你啊~~~
16s
rDNA不是提取出来的~~~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA。然后你把PCR产物纯化一下送交
测序
公司测序,或者花点钱让测序公司帮你纯化。
如何知道细菌的
16s
rRNA的完整序列
答:
提取细菌总DNA再用细菌
16s
rDNA通用引物PCR出16s序列,电泳找到所需条带,回收然后送到
测序
公司测序
使用R处理一代
测序
的
结果
数据
答:
3、R代码是指使用R语言时书写的代码。R是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。4、高质量:由于Sanger测序技术可以生成相对较长的读段,因此可以获得高质量的
测序结果
,质量得以保障。高精度:Sanger测序技术的误差极小,同时也具有低重复率的优点,因此可以为生物学研究提供极为精确的数据支持。5、...
细菌如何提取
16s
rDNA(用来做种类鉴定的)
答:
- - 还是你啊~~~
16s
rDNA不是提取出来的~~~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA。然后你把PCR产物纯化一下送交
测序
公司测序,或者花点钱让测序公司帮你纯化。
测序结果
能知道各个细菌种类的含量分别是多少吗
答:
专业上讲叫种群丰度 一般观察这种丰度细菌是通过
16S
rDNA的高变区V区来确定物种 一代
测序
是通过PCR来扩增出特定V区,进行克隆后,一代测序进而分析,但是克隆挑选的数目对丰度的准确评估有很大影响(越多越好)二代测序pcr后直接进行测序,来找特定丰度,二代测序的高通量有这更好的适用性。
为什么同一种微生物的
16s
rdna系列相同而电泳的位置不同
答:
要么是模板不纯,要么是引物不纯,能
测序
的话是最好找原因的
测序
时目的片段长度怎么写,要对一个细菌做鉴定,看它是不是细菌性穿孔...
答:
测序订单上目的片段长度即你扩增的基因片段大小。做细菌鉴定,可以采用最常的
16s
rRNA的通用引物,例如27F/1492R等进行PCR扩增,扩增所得1500BP左右的片段进行测序,
测序结果
再与数据库中的序列进行比对确认,是否是细菌性引起的问题。
要对培养好的微生物进行
测序
,之前要做什么准备
答:
还要把产物纯化后连接到克隆载体上,一般使用T载体,然后进行转化,把最后得到的菌株送到公司
测序
.如果你用杂菌提取基因组,然后扩增片段,我不知道你得到的是什么东西,就算做出来了,送到公司得到的
结果
也会是公司最后告诉你,你的东西不是单克隆,他们测不出来,你做的也是无用功,所以还是把菌纯化了再说.
宏基因组
测序
原理?
答:
同时将获得的reads片段或组装好的基因序列与NCBI数据库进行比对,得到物种注释
结果
。对于
16S测序
而言,任何一个高变区或几个高变区,尽管变异性再高,对于某些物种来说,这些高变区也可能十分相近,而能够区分它们的特异性序列片段有可能不在我们的扩增区域内。换言之,非全长的可变区序列覆盖范围不够...
细菌如何提取
16s
rDNA(用来做种类鉴定的)
答:
- - 还是你啊~~~
16s
rDNA不是提取出来的~~~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA。然后你把PCR产物纯化一下送交
测序
公司测序,或者花点钱让测序公司帮你纯化。
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