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16s测序需要多少个细胞
巨集基因组
测序
都能得到那些结果?可以用于什么研究?
答:
巨集基因组
测序
可以不组装进行分析吗 功能基因芯和巨集基因组测序的区别基因组,Genome,一般的定义是单倍体
细胞
中的全套染色体为一个基因 病毒巨集基因组测序为什么要一定的bp 测序不是按碱基算的,而是按反应的算得,现在在上海这边一般在25-30元之间一个反应,一个反应保证有效读数在800个碱基.如果基因组测序现在多...
16s
rrna序列全长包括通用引物吗
答:
通用引物1492r/F27,pcr后去
测序
,因为测序软件的自身原因,测出来开头的序列是杂带不准确,如果
需要16s
RNA的全长,必须做TA克隆,就需要载体的问题了。如果你要求鉴定菌种只到属,完全可以用通用引物。
细菌
16s
rRNA通用引物是什么
答:
通用引物1492r/F27,pcr后去
测序
,因为测序软件的自身原因,测出来开头的序列是杂带不准确,如果
需要16s
RNA的全长,必须做TA克隆,就需要载体的问题了。如果你要求鉴定菌种只到属,完全可以用通用引物。
三代
测序
入门
答:
对长插入片段文库的测序基本是少于2 passes的(pass即环绕测序的次数),得到的reads也称为 Continuous Long Reads (CLR) ,这样的reads测序错误率等同于原始的测序错误率。 而对于全长转录组或全长
16s测序
,构建的文库插入片段较短,测序会产生多个passes,这时会对多个reads进行一致性校正,得到一个唯一的read,也称为 Ci...
测序
时目的片段长度怎么写,要对一个细菌做鉴定,看它是不是细菌性穿孔...
答:
测序
订单上目的片段长度即你扩增的基因片段大小。做细菌鉴定,可以采用最常的
16s
rRNA的通用引物,例如27F/1492R等进行PCR扩增,扩增所得1500BP左右的片段进行测序,测序结果再与数据库中的序列进行比对确认,是否是细菌性引起的问题。
细菌
16s
rRNA通用引物是什么
答:
通用引物1492r/F27,pcr后去
测序
,因为测序软件的自身原因,测出来开头的序列是杂带不准确,如果
需要16s
RNA的全长,必须做TA克隆,就需要载体的问题了。如果你要求鉴定菌种只到属,完全可以用通用引物。
对细菌进行
测序
时,测的是
16S
rDNA还是16S rRNA
答:
测的是
16s
rDNA序列,或者说是16s rRNA 基因
测序
结果能知道各个细菌种类的含量分别是
多少
吗
答:
测序
分为一代测序和二代测序(两者差别,一代测序准确性高,通量低,二代测序通量高)一般确定各个细菌种类的含量,专业上讲叫种群丰度 一般观察这种丰度细菌是通过
16S
rDNA的高变区V区来确定物种 一代测序是通过PCR来扩增出特定V区,进行克隆后,一代测序进而分析,但是克隆挑选的数目对丰度的准确评估...
16S
rDNA
测序
后在ncbi上比对
答:
是的。99%就基本可以认为是同一种菌。不过我问一下你是不是做了TA克隆获得了
16s
rDNA全长序列。你之前也问过这个问题,我跟你说了不是直接上NCBI上比对的,NCBI上的序列是人人都可以上传的,你比对出来和某个序列99%相似,可能这条最相似的序列并没有被正式承认,也就是没有被正式学术资格的。你...
细菌如何提取
16s
rDNA(用来做种类鉴定的)
答:
- - 还是你啊~~~
16s
rDNA不是提取出来的~~~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA。然后你把PCR产物纯化一下送交
测序
公司测序,或者花点钱让测序公司帮你纯化。
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