22问答网
所有问题
当前搜索:
BSA混池测序
动植物重
测序
--
BSA
答:
不建议⽤
BSA
的结果检测 SV、 CNV,第⼀、
测序
深度不够;第⼆、 BSA ⼦代是
混池
样本,混池样本做⼤结构变异检测误差较⼤,且没有分析意义; 想做⼤结构变异检测,建议⽤新技术做, Bionano、三代、 10X Genomics 或者测 30X ⼆...
混合(Pooling)样本
测序
研究
答:
BSR(Bulked segregant RNA sequencing)同样依据分组混合的原理,在RNA水平上进行高通量
测序
并定位候选基因,即
BSA
+RNAseq。BSR的
混池
同样选取分离群体中的极端性状单株,混池用的单株数会比BSA多一些(大多大于30),提取RNA进行混池,再进行转录组测序,mapping参考基因组后同样进行变异分析,确定候选区间。
《
BSA
》-生信笔记---003
答:
答: 2013年, James等对
混池
个体数和
测序
深度对候选基因数的影响进行了评估。下图是评估结果,结果显示,当子代个数超过20个,测序深度达到25x以后,候选基因个数会趋于平衡,不会有更明显的提升效果。基于以上文章经验以及已完成的
BSA
项目经验,推荐20个个体进行混池,每池20×的测序深度。4、DNA样品如何混...
RNA混合
池
是什么意思?还有DNA混合池是什么意思?
答:
混合
池
是混合群体分离法里面的一个概念。混合群体分离法,(
BSA
)这是遗传学实验中的一种手段 当你针对一个形状研究时,你不容易找到DNA(基因组)或是RNA(转录组)上面的遗传信息的差异对你所研究的形状起到什么作用,因为遗传信息的差异是很多的,很难与所研究形状对应。因此我们可以人为瞄准这一个...
2.
BSA
的原理
答:
BSA
(Bulked Segregant Analysis),集群分离分析或分离群体分组分析法。 两个特点: 1.
混池
2. 性状分离 所以,BSA可以称之为分析有性状分离的群体分析方法。性状控制基因的初步定位
分子育种重
测序
应用方案
答:
检测到的两
混池
间DNA差异片段即为候选区域,可进一步定位到目标性状相关的基因或标记。但是最好不要选择简化基因组进行
BSA
,因为简化基因组
测序
捕获到的基因组区域有限,若变异区域未被捕获,则与目标性状相关的基因将不能获取,因此全基因组重测序在BSA性状定位方面具有明显的优势。针对质量性状定位的方法:...
其他人还搜
BSA混池送测样本要求
BSA混池测序基本原理
极端DNA混池的构建
Bsa测序分析技术
bsa混池测序结果怎么看
InDel标记是混池法嘛
BSA测序深度
BSA定位性状
BSA技术路线图