22问答网
所有问题
当前搜索:
qpcr下降的基因在转录组没差异
转录组
结果和qRT-PCR结果又不一致?!
答:
首先需要看进行不一致的程度分析:其次思考可能存在的原因在哪里?3.分析
差异
表达
的基因
的readcount一般在多少比较比较合适?原始文献:Everaert C, Luypaert M, Maag J L V, et al. Benchmarking of RNA-sequencing analysis workflows using whole-transcriptome RT-
qPCR
expression data[J]. Scientific...
如何处理
qPCR
验证与
转录组
测序结果不一致
答:
qpcr
是对量进行检测的多数,你是要看你
的转录组
的表达量的多少吧,如果与测序做对比是没有明确意义的,实在要做的话,那你需要对你的整个转录本都进行定量才能出来对比结果
转录组
数据如何和
qpcr
数据相关列
答:
1、首先打开电脑,并点击主页面上的acapp。2、其次进入主页面,点击上方的相关列。
3、最后选择转录组数据和qpcr数据即可。
如何处理
qPCR
验证与
转录组
测序结果不一致
答:
找找不一致的原因吧,取样条件、操作流程、人为的还是天然存在的,总之只要能重复的结果都是可信任的结果。
转录组
数据和实时定量相反怎么办
答:
结果不一致的可能原因 1 比对关系 样品的比对关系搞反了(A vs B)导致了结果相反 2 样本批次 没有用同一批次样本做
转录组
和
qPCR
导致了结果
差异
3 样本污染 样品存在rRAN污染或者其他物种污染导致了转录组中的FPKM计算有误 4 基因表达量(FPKM)偏低 做qPCR验证
的基因
表达量(FPKM)偏低...
转录组
测序5-
基因差异
表达分析
答:
转录组
测序是最常用的组学实验,对全谱基因定量,找到差异表达基因。RNAseq涉及到原始数据,数据质控,
基因组
比对,
差异基因
鉴定,差异基因功能富集分析,重要基因如转录因子激酶的靶基因预测等,我们用10讲的时间,全面讲解转录组测序报告,及在上百个项目中遇到的近百个常见问题。 上一期视频 基因表达定量 中,我们讨论了在cl...
WGCNA分析--提升
转录组
测序文章档次的利器
答:
差异基因比较分析: 作者主要比较了相同发育状态不同品种之间
的转录组差异
比较,差异基因的上下调数量和其中转录因子的数量图a,另外还统计差异基因中不同类型转录因子的数量展示图b,图c为不同时期差异基因的富集结果,颜色越深说明在该功能上越富集,最后S3时期
差异基因在
mapman中的Metabolic pathways做了富集分析,可以将...
转录组
测序后
差异
表达
基因
太多?这4招解决你的难题
答:
在进行
转录组
测序后,面对差异表达
基因
过多或过少的挑战,这里有四个实用策略帮助你解决。首先,对初步筛选
的差异
表达基因,可根据样品特异性选择合适的DEG检测方法,如DEGseq、DEseq2、EBseq、NOIseq或PoissonDis,调整筛选条件以满足具体需求。其次,进行功能注释,通过GO、Pathway分析,以及转录因子、蛋白...
荧光定量pcr与FPKM值有什么
差别
?
答:
然而,当
转录组
与qPCR结果不一致时,需要深入分析。可能是
基因的差异
表达不显著,导致qPCR结果不稳定;或者可能是引物设计、实验材料准备、样本处理等环节存在问题。例如,引物的特异性问题、实验材料的保存条件、样本处理过程中的误差,都会影响
qPCR的
准确性。在进行qPCR时,尤其需要细心操作,考虑到重复实验的...
转录组
谜团
答:
比对环节有两个选择:一是比对参考
基因组
(genome),可以帮助发现新转录本以及gene isoforms;二是比对参考
转录组
(transcriptome),也就是在已知基因的前提下,更准确的定量样本中信息 有许多测序reads是来自两个外显子的连接处(也就是剪切位点),如果要比对会参考基因组,reads的中间肯定会被加入一段...
1
2
3
4
5
涓嬩竴椤
其他人还搜
转录组表达差异的基因如何筛选
转录组差异基因
转录组差异基因特别多
转录组差异基因分析
转录组测序如何筛选差异基因
转录组差异基因数量多少算正常
转录组差异基因筛选标准
转录组中筛选差异基因
差异基因转录的调控机制