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seqman比对测序结果
怎么样用
seqman
来拼接
测序结果
答:
打开seqman,点sequence--add,选择你的结果,每选一个,点右边的add,全选完后,点done
。之后左上出现的对话框中点Assemble。会出现一个report,双击变蓝色的字,即可得到比对的格式,在最上方显示的就是你所说的拼接结果。 这个文库有文档专门介怎么样用seqman来拼接测序结果 ...
怎样用
seqman
看
测序结果
答:
打开seqman,点sequence--add,选择你的结果,每选一个,点右边的add,全选完后,点done
。之后左上出现的对话框中点Assemble。会出现一个report,双击变蓝色的字,即可得到比对的格式,在最上方显示的就是你所说的拼接结果。
测序结果
怎么拼接
答:
测序实际上就是一个PCR反应。两个反应就是以上有引物引发和下游引物引发的两个反应。
测序结果
拼接其实很简单,你看你的两个测序结果的后面应该有一段重叠区(如果测通的话),通过重叠区拼接起来就可以了。DNAman里可以自动拼接的。你说的那几个软件在百度文档里就有下载。我手头有mage、DNAstar和Clust...
seqman
看不到
测序
峰图
答:
首先打开软件,点file,点new,点skip
。然后弹出新对话框,点击addsequences,找到测序文件所在文件夹,在文件类型中选中四个测序结果,点打开,再点done。再点assemble,软件就会自动拼装序列。加入我们已知的参考序列,点菜单栏的sequence中的addone,找到参考序列所在文件夹,单机它打开,就加了一个参考序...
怎样分析
测序结果
答:
用Chromas等软件打开测序结果,查看峰图质量和序列是否正确
。比对序列的话我个人更习惯用seqman软件
DNAstar中
Seqman
拼接序列使用方法
答:
启动
Seqman
,点击面板中的Addsequence 按钮添加将要拼接的序列选中目标序列,点击Add--Done导入目标序列 如果导入的是峰图文件,可以双击文件名会弹出峰形图,通过移动黑色的分隔线可以去除
测序
质量不高的区域(黄色区域),从而避免在拼接过程中产生模棱两可的数据。 数据修正后点击Assemble即拼接...
SNP应该如果确定呢?
答:
可以重
测序
得出。突变率有1/100以上的为snp(好像是这个概率)。用序列分析软件如
seqman
、chromas等等
比对
不同个体(比如测10个人的人的5号染色体的某一个基因里某一段PCR)的碱基序列。不同者,为snp。
直接
测序
法怎么分析基因多态性
答:
测序
完成后用生物学软件对序列进行
比对
,比如chromas或者
seqman
测序
得到的ab1文件序列怎样反向
答:
一段序列
测序
后,得到两个ab1文件,用
Seqman
进行序列拼接时发现,两条序列方向一致,怎样将其中一条弄成反向的。并且不丢失峰图。刚刚接触到Seqman这个软件,不知道自带这个功能不?一段序列测序后,得到两个ab1文件,用Seqman进行序列拼接时发现,两条序列方向一致,怎样将其中一条弄成反向的。并且不丢失峰...
16srDNA 测出的两条序列都要
比对
吗?要拼接吗? 请高手指导一下,详细最好...
答:
双向
测序
得到的两个序列如果有重叠区的话,那么可以做拼接。另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较,通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列。做拼接有专门的软件,如DNAstar里面的
SeqMan
,VectorNTI里的contigexpress,DNAman里面的sequence assembly都是可以做拼接的。如果你把克隆的16srDNA克隆到载体上...
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