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基因注释怎么看
2019意犹未尽的
基因
组可视化IGV(一)
答:
然后看右上角的 + ,可以缩放,让我们看碱基看的更清楚,直到单碱基水平,它会先从
基因
开始显示,当放大到一定程度时,序列信息就展示出来(看来自官网的解释: https://software.broadinstitute.org/software/igv/sequence_track_options )(只要之前添加了基因名的
注释
track),例如直接在长条框中输入 ...
soe454(
基因
组学与生物信息学)
答:
在soe454课程中,学生将学习
如何
利用先进的测序技术来获取基因组数据,并通过生物信息学手段对这些数据进行解读和分析。例如,学生可能会接触到基因组组装、
基因注释
、基因表达分析、变异检测等关键技术和方法。同时,课程还可能涉及生物大数据的存储、管理和可视化等内容,以便学生能够全面了解基因组学和生物信息...
遗传解读工作中
如何
选择转录本的使用及如何查找相关转录本?
答:
在遗传解读中的选择</在临床解读中,推荐使用MANE(Matched Annotation from NCBI and EMBL-EBI)数据库,它整合了NCBI和EMBL-EBI的权威
注释
,提供最具代表性和生物信息学意义的转录本。MANE Select以其严格的筛选和专家审核,代表了
基因
区域的生物学特性,常被用作报告和基因组分析的基准。而MANE Plus ...
什么是orf?在
基因注释
中orf有何意义
答:
如果你是
基因
组序列的话,并不能用NCBI里面的那个ORF finder工具,该工具只是简单的将你所输入的序列按6种可能的阅读框进行翻译,然后输出编码最长氨基酸的那种阅读框,你是基因组序列,你得先知道该基因编码的mRMA序列,你知道了cDNA序列你才能进一步分析该基因中的外显子和内含子,甚至该基因的启动子,...
CHIP-Seq(7):对peak进行
注释
和可视化
答:
这里需要注意的是,启动子区域是没有明确的定义的,所以你可能需要指定tssRegion,把
基因
起始转录位点的上下游区域来做为启动子区域。有了这两个输入(BED文件和TxDb对象),你就可以跑
注释
了,然后就可以出结果了。1.peakAnnoList 2.
查看
具体信息,会显示出每个peak的位置,所在的区域 as.GRanges(peak...
基因
组
注释
的系统方法
答:
本系统也可在单CPU 微机上运行,内存不小于512MB。所有系统软件和应用软件均可以从Internet 网上免费获得。112 测试数据本系统用蓝细菌( Synechococcus sp. ) PCC7002
基因
组初步拼接所得最大重叠连续群(Contig) 作测试数据,共3 03247bp 。113 MGAP 的基因组
注释
系统基因组注释系统是MGAP 的核心,...
染色体位置
如何注释
到
基因
名
答:
python gff3文件: https://www.gencodegenes.org/human/release_19.html python包:样式1 输出样式2 提取gff3文件中所需要的信息 提取基因名,基因类型,基因状态,基因水平(1verified loci,2manually annotated loci,3automatically annotated loci)
查看基因
类型分布 提取所有已知的蛋白编码基因 压缩 ...
david可以对一个
基因
进行
注释
吗
答:
可以批量输出,你把你需要的项选中,然后选择“functional annotation”菜单,选择“functional annotation table”,新开的窗口右上角有软盘的图标,点击“download file”即可,你需要的所有
注释
就会下载到一个txt文档中。
动物
基因
组和植物基因组有什么区别?
答:
虽然动物和植物
基因
组使用同一套编码语法(几乎同一套),例如相同的基因结构(启动子、编码区)、翻译体系(三碱基密码子和氨基酸对应关系)、RNA结构等等。但是当你对基因组的理解到达这个程度时,两者的区别就足够明显。当你能破译部分基因组序列所包含的信息时。比如RuBP,号称这个星球上储量最大的蛋白...
高中生物,
怎么看
电泳结果图
答:
图中一定会有一列,一般在最左最右彧中间,像梯子一样的,那个是marker,是用来指示条带大小的,在每一个条带边都会有具体大小的
注释
。marker的每个条带对应的同一水平位置分子量大小一致。除这一列以外的条带都是样品。将样品条带所处的水平位位置与marker的各个条带位置比较,可用于估计样品的分子量...
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