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测序数据分析
测序
reads数量有什么含义啊?
答:
样本复杂性和覆盖度: 测序reads数量可以反映样本中DNA或RNA的复杂性。如果一个样本中的reads数量非常多,通常意味着该样本的DNA或RNA具有较高的复杂性,包含了大量不同的序列信息。这对于研究多样性和覆盖度非常重要。基因组覆盖度: 在基因组测序中,reads数量可以用来评估基因组的覆盖度,即
测序数据
中...
cdna
测序
怎么控制从3'端测序和5'端测序
答:
它是一台能自动灌胶、自动进样、自动
数据
收集
分析
等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA
测序
胶(POP 6)和GeneScan胶(POP 4)。这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、...
有颜色的pcr产物对毛细管电泳有影响吗
答:
它是一台能自动灌胶、自动进样、自动
数据
收集
分析
等全自动电脑控制的测定DNA片段的碱基顺序或大小和定量的高档精密仪器。PE公司还提供凝胶高分子聚合物,包括DNA
测序
胶(POP6)和GeneScan胶(POP4)。这些凝胶颗粒孔径均一,避免了配胶条件不一致对测序精度的影响。它主要由毛细管电泳装置、Macintosh电脑、彩色...
同样是做
测序
,为什么人家能发Nature
答:
随着物种
测序
项目越来越多,出现这种情况的几率也越来越大,只要双方的研究思路不同,能够挖掘到有意义的
分析
角度并很好地阐明问题,物种基因组测序就不再怕重复。例如,2012年先后发表于Nature Genetics(2012.08)及Nature(2012.12)的两篇棉花基因组测序的文章,今年先后发表于Nature(2013.04)及Genome...
什么实验适合做转录组
答:
反映出它们的表达水平。基因表达谱指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA
测序
,收集cDNA序列片段、定性、定量
分析
其mRNA群体组成,从而描绘该特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰度信息,这样编制成的
数据
表就称为基因表达谱。
什么是转录组
分析
?
答:
转录组
分析
指对细胞内所有转录产物的集合的分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。转录组
测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高...
高通量
测序
Illumina HiSeq 2000 和Roche454 两种平台的区别_百度知 ...
答:
测序
长度来讲,Hiseq2000一般为1X100和2X100的模式,而454平均500bp左右,最长700左右,测序准确度来讲Hiseq的测序准确度稍高一些,454由于在测序的过程每次是加一种碱基,所有如果是单碱基重复,比如AAAA,那么区分几个A的准确性就会下降。2.
数据分析
和应用方向 数据分析相差不大,只是不同的软件,应用...
如下哪个生物信息学方法可以用来寻找新基因
答:
随着大规模实验技术的发展和
数据
累积,从全局和系统水平研究和
分析
生物学系统,揭示其发展规律已经成为后基因组时代的另外一个研究 热点-系统生物学。目前来看,其研究内容包括生物系统的模拟(Curr Opin Rheumatol,2007,463-70),系统稳定性分析(Nonlinear Dynamics Psychol Life Sci,2007,413-33),系统鲁棒性分析(Ernst Sc...
第二代DNA
测序
技术的操作流程
答:
4、单碱基延伸
测序
在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dNTP 、DNA聚合酶以及接头引物进行扩增,在每一个测序簇延伸互补链时,每加入一个被荧光标记的dNTP就能释放出相对应的荧光,测序仪通过捕获荧光信号,并通过计算机软件将光信号转化为测序峰,从而获得待测片段的序列信息。5、
数据分析
这一步严格...
肿瘤基因检测的费用大概是多少呢?
答:
针对不同的检测项目以及所使用的
测序
平台不同,基因检测的价格从几百元到几万元不等。基因检测价格主要是根据检测基因个数决定的,单个系统的检测是5000块左右。癌症是由控制细胞生长和分裂方式的DNA变化引起的。这些变化是可以遗传的,但是大多数变化是在人的一生中随机发生的,这可能是由于细胞分裂或暴露...
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