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编码基因的注释
vadr是什么意思啊?
答:
VADR是指Viral Annotation DefineR,是用于病毒基因组注释的工具。病毒基因组
的注释
对于理解病毒的基本生物学特性以及其致病机理非常重要。VADR的开发旨在提供一种高效、精确的病毒基因组注释工具,它可以自动地预测
基因的
位置、开放阅读框架、转录起始点等结构特征,并可以在注释中标记预测的错误和需要人工验证的...
...对于没有参考
基因
组信息的序列怎样进行
注释
,差异分析 ???_百度知 ...
答:
转录本是一个
基因
序列通过一种剪切后所得的能RNA。以前说转录本都是说表达蛋白的。现在LncRNA的研究多了,也说是一个转录本了。还有没有参考基因组序列的,一般是不可能去GO功能
注释
的。因为去功能注释的时候要有一个背景。
如何使用
基因注释
软件dogma
答:
基因
组
注释
系统是MGAP 的核心,整合了许多常用的基因识别和蛋白质功能预测软件,包括GeneMarks、IPRsearch、BLASTPGP 和FASTA3 等,以及多个数据库,如非冗余蛋白质序列数据库(Non redundant ,NR)、已知三维空间结构的蛋白质序列数据库(PDBSeq)、国际蛋白质资源信息系统(InterPro)[6]和直系同源蛋白质家族数据...
参考
基因
组
注释
为什么会有mRNA
答:
这个很正常,因为一个注释文件包含了很多种类型
的注释
。以gff格式为例,第三列类型中包括“Gene” “cDNA” “mRNA” “exon”等。
基因注释
与功能的分类(3)
答:
富集分析方法通常是分析一组基因在某个功能结点上是否过出现(over-presentation)。这个原理可以由单个
基因的注释
分析发展到大基因集合的成组分析。由于分析的结论是基于一组相关的基因,而不是根据单个基因,所以富集分析方法增加了研究的可靠性,同时也能够识别出与生物现象最相关的生物过程。常用的功能富集...
基因
结构
注释
(2):同源注释
答:
首先选择同源物种,在本次分析中,我使用Saccharomyces_cerevisiae、Laccaria_bicolor、Amanita_thiersii、Pleurotus_pulmonarius、Pterula_gracilis进行同源
注释
然后使用TBLASTN确定匹配到
基因
组的蛋白序列 使用gth进行同源注释 删除一些无用的信息可以看到基本已经注释完成,但是exon之类的没有ID,在后续识别会有...
斑马鱼
基因
敲除常规流程及关键步骤质控标准及
注释
答:
一、设计方案 1.1
基因的
基本信息 确认基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。1.4分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可...
基因注释
是myb 后面加个related是啥意思啊?
答:
related 的意思是“与之有关联”。附图的第一行表述是苹果,这是苹果的
基因注释
??
GO(Gene Ontology)
答:
GO通过三个方面的术语对基因/
基因
产物的功能进行描述:分子功能(molecular function) -由基因/基因产物行使的分子水平上的功能; 细胞组件(cellular component)-基因/基因产物产生功能时其在细胞结构上的位置;生物学过程(biological process)-在哪个生物学通路/生物过程发挥作用。目前,GO
注释
主要有两种方法...
核糖体结合位点(RBS)在
基因注释
中有什么作用
答:
核糖体结合位点(RBS)在
基因注释
中有什么作用 核糖体的主要成份为蛋白质和rRNA,二者比例在原核细胞中为1.5:1,在真核细胞中为1:1,每个亚基中,以一条或二条高度折叠的rRNA为骨架,将几十种蛋白质组织起来,紧密结合,使rRNA大部分围在内部,小部分露在表面。由于RNA的磷酸基带负电荷超过了蛋白质...
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