22问答网
所有问题
当前搜索:
转录组分析有哪些
生物信息学在
转录组
数据
分析
中的主要应用
答:
生物信息在生物学研究上的应用主要包括在基因组学研究上的应用和在蛋白质组学研究中的应用。1、在基因组学研究中的应用 基因组(genome)表示一个生物体所有的遗传信息的总和。一个生物体基因所包含的信息决定了该生物体的生长发育、繁殖和消亡等所有生命现象。有关基因组的研究称为基因组学(Genomics)...
一文掌握GO和pathway
分析
答:
在
转录组分析
中,筛选关键目标基因的关键在于精准定位。以文章"Identification of a novel biomarker, SEMA5A, for non-small cell lung carcinoma in nonsmoking women"为例,作者通过Affymetrix U133plus2.0芯片检测,首先筛选出687个差异表达基因。为了缩小范围,他们运用IPA软件进行功能分析,特别关注了...
有参
转录组分析
答:
随后利用 ballgown 或者 featurecount 得到表达矩阵进行下游
分析
对于可变剪切一般使用 rMATs 进行统计,rMATS是一款对RNA-Seq数据进行差异可变剪切分析的软件。其通过rMATS统计模型对不同样本(有生物学重复的)进行可变剪切事件的表达定量,然后以likelihood-ratio test计算P value来表示两组样品在IncLevel(...
WGCNA
分析
--提升
转录组
测序文章档次的利器
答:
现在做
转录组
测序,看看差异基因,做做富集
分析
,再讨论下差异基因功能与自己研究性状或处理之间的关系,最后加简单的qPCR验证,这样的数据发SCI影响因子越来越低了。必须增加新的分析内容才能有所突破。今天给大家介绍一个能给文章增色的分析内容--基因共表达网络分析(WGCNA),该分析对样品数有一定要求,建议不少于15个,不...
农学领域DNA甲基化分析+
转录组分析
+小RNA整合分析,直逼10分
答:
农学研究中,一项结合DNA甲基化、
转录组
和小RNA
分析
的深入探究揭示了木豆杂交品种表观遗传调控对基因表达影响的关键机制。2020年的一项成果发表在《植物生物技术杂志》上,影响因子高达9.8。研究聚焦于提升产量的商业杂交品种ICPH 2671和ICPH 2740,与亲本比较,发现杂种在播种期即展现出显著优势,且杂种...
生物信息学
分析
包括
哪些
内容
答:
生物信息学
分析
主要包括基因组学分析、
转录组
学分析、蛋白质组学分析以及代谢组学分析等内容。基因组学分析是生物信息学的重要组成部分,主要关注生物体基因组的测序、组装和注释。通过分析基因组的序列信息,可以了解生物体的遗传特征、基因结构、基因功能和调控机制。例如,在人类基因组计划中,科学家们通过...
空间
转录组
答:
空间转录组的璀璨篇章 在2020年的科学界,空间转录组技术以其卓越的创新和深度解读细胞和组织层次结构而备受瞩目。这一领域的技术方法主要分为两大类别:一是基于空间条形码的精准定位,如10X Visium、Nanostring DSP和华大科技的Stereo-seq;二是原位
转录组分析
,例如smFish、seqFish和In situ Sequencing (...
单细胞
转录组
之拟时序
分析
答:
前面根据差异基因,推断好了拟时序,也就是说把差异基因动态化了,后面就可以具体推断
哪些
基因随着拟时序如何的变化 以qval前六的基因做图 将一个或多个基因的表达绘制点图 将前50个随拟时序变化的基因做聚类热图 分支表达
分析
建模 识别
具有
分支依赖性表达的基因。使用全部的基因进行绘图 创建一个热图来...
转录组分析
一般放在论文的哪里
答:
论文的
分析
部分。
转录组
(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,转录组是连接基因组遗传信息...
10X空间
转录组
数据
分析
梳理
答:
空间
转录组
学 (ST) 技术正迅速成为单细胞 RNA 测序 (scRNAseq) 的延伸,
具有
以单细胞分辨率
分析
基因表达的潜力,同时保持组织内的细胞组成 。同时拥有表达谱和组织组织使研究人员能够更好地了解细胞相互作用和异质性,从而深入了解传统测序技术无法实现的复杂生物过程。 ST 技术生成的数据本质上是嘈杂的、高维的、稀疏...
<涓婁竴椤
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜