22问答网
所有问题
当前搜索:
转录组测序数据分析流程
转录组
图谱是什么意思?
答:
研究人员通过测定细胞或组织中mRNA的数量和类型来构建
转录组
图谱。利用新一代
测序
技术,如RNA-seq,可以在较短的时间内以高分辨率得到转录组图谱的信息。这可以帮助研究人员更深入地研究基因功能和生物学
过程
。通过构建转录组图谱,研究人员可以使用不同的算法和工具对
数据
进行
分析
,并揭示细胞内基因表达和...
克隆好的植物抗性基因如何进行
测序
表达?
答:
1、
测序
:根据克隆片段的大小,设计、选择测序方法。如果在5 Kb以下,直接告诉公司,你用的质粒,就可以了。如果大于5 Kb,需要亚克隆,这个有些公司也可以帮助直接完成。就是钱都一些。2、注释:测序完成后,要组装,注释。如果是cDNA,就容易找到起始密码子和终止密码子。如果是基因组DNA,那就先
分
...
单细胞
转录组
差异表达
分析
——DEsingle
答:
上一篇说道SCDE包进行单细胞
测序
的差异表达
分析
。这一篇就来说说DEsingle这个包。1、安装 先上包的官网链接 https://github.com/miaozhun/DEsingle/ 安装方法 2、示例
数据
预分析 载入包和数据 分组。划重点:这个包奔溃的一点是只能比较两个组。如果srurat出来还几个组,那就只能两两比较。或者,如果...
文献解读|单细胞联合空间
转录组测序
揭示脑神经炎性星形胶质细胞亚型...
答:
通过对约80,000个星形胶质细胞进行单细胞
转录组测序
,发现炎症引起了广泛的反应,亚型星形胶质细胞经历了不同的炎症转变,并具有明确的转录组特征。利用空间转录组学和原位杂交技术,研究团队将炎症诱导的反应性星形胶质细胞的关键亚状态定位于大脑区域。这些
数据
集为
分析
星形胶质细胞异质性提供了强大的资源,...
转录组
是什么意思啊?
答:
转录组研究的技术和方法 1、转录组研究的技术 转录组研究需要采用一系列的技术和方法,有高通量
测序
技术、生物信息学
分析
方法。高通量测序技术是获取
转录组数据
的主要手段,有RNA测序、cDNA测序技术。2、转录组研究的方法 生物信息学分析方法是处理和解析转录组数据的关键
步骤
,有序列比对、基因注释、表达...
滚蛋吧肿瘤!高性能计算:没有它谈何精准医疗?
答:
进行这两套
测序数据分析
以后也没有找到对他个人有特异的这个靶点,之后对Dr.Lucas进行
转录组
的测序的时候,花了一个多星期的时间找到了一个FLT3的基因,这个基因的表达和其他基因的表达差距非常大,之后把这个信号输入计算系统也是DGIdb的选药,筛药和治疗方案的一个自动化的系统,找到了一种药,给Dr....
文献--桔梗全基因组、
转录组
、甲基化
组分析
以及桔梗皂苷生物合成研究...
答:
基因表达表现为来自8个不同组织的RNA-Seq
数据
的每百万
测序
reads (FPKM)中每千碱基转录物的log2片段。星号(*)表示基因在根中的表达明显高于其他组织(p<0.001;Fisher检验)。2)
转录组分析
结果: 通过转录组证实了组织特异性的基因表达。在扩张的bASs基因家族中,研究人员...
转录组
结果和qRT-PCR结果又不一致?!
答:
转录组测序
(RNA-seq)将细胞内某一类型(或全部)的RNA逆转录成DNA,通过高通量测序的方法测定其序列并统计其表达水平的一项技术。是检测基因表达变化的通用方法。qRT-PCR 是指通过对 PCR 扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的
分析
。RNA-seq无需知道实验样本的基因...
...利用多组学
分析
联合三种公共
数据
库和多角度实验验证,拿下12+...
答:
北大人民医院申占龙团队在乙酰化这一生物化学热点领域取得显著成就。他们利用多组学
分析
,结合TCGA、ENA和GEO三种公共
数据
库的数据,以及
转录组
自
测序
、单细胞测序等多种实验手段,进行了深入研究。他们的工作涉及了胃癌这一重大疾病,通过HDAC评分(HDS)模型评估胃癌微环境,并揭示了HDACs在不同表达亚型中的...
转录测序
中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思
答:
KOG与COG提供了相似的基因同源物的分类信息。KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 是处理基因组、生物通路、疾病、药物和化学物质之间联系的集成数据库。 KEGG用于生物信息研究等,包括基因组,代谢组学等其他组学的
数据分析
,涵盖了Drug Development(药物开发)、 Cellular Processes(细胞
过程
)、 ...
棣栭〉
<涓婁竴椤
18
19
20
21
22
23
25
26
27
涓嬩竴椤
24
其他人还搜