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高通量测序的步骤
宏基因组
测序流程
答:
发掘和研究新的具有特定功能的基因等。与传统方法相比,基于
高通量测序的
宏基因组研究无需构建克隆文库,这避免了文库构建过程中利用宿主菌对样品进行克隆而引起的系统偏差,简化了实验操作,提高了测序效率。此外,宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物...
测序的
详细原理,需要什么准备知识吗?
答:
测序分为常规测序和
高通量测序
。1.Sanger法
测序的
原理 就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸...
NIPT(无创产前
DNA
检测)技术的解说及运用(五)
答:
1、NIPT检测样本的采集 首先孕妇们到采血室采外周血(5ml—10ml)后,血液样本会直接送到
高通量测序
实验室。部分医院没有资质做相关检查,样本就会往上或合作单位继续送检。NIPT检测采血管需专用的采血管,由于有的地方血液样本不能做到及时送检,所以对采血管的要求更高。目前常用的有美国...
iclip技术是什么
答:
iCLIP技术是一种用于表征RNA结合蛋白与RNA交互作用的
高通量测序
方法。能够以亚单核苷酸分辨率定义RNA和蛋白质交互位点。iCLIP技术可以在细胞中用紫外线刺激将RNA和蛋白质交互结合的位点上进行交联,并且通过RNA免疫分离和蛋白质酶切等
步骤
来纯化RNA和结合的蛋白质。在纯化后的样品中使用RT-PCR扩增RNA序列,...
易基因|全基因组
DNA
甲基化
测序
分析全
流程
答:
利用trim_galore软件对原始数据进行去除接头序列及低质量碱基等质控
步骤
。 (二)序列比对 经过质控的reads需要根据与参考基因组的序列相似度比对到参考基因组上。相比于常规基因组及转录组
测序
,WGBS测序方法产生的数据的特点决定其在比对时存在三大困难: (1)
DNA
片段正链和负链经过重亚硫酸盐转化后将不再反向互补,再...
高通量测序
中的reads、contig、scaffold什么意思?
答:
高通量测序
时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序;就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较短,平均是几十到几百bp。PE reads 就是 paired-end reads。在测序过程中,一条DNA分子的两端都可以测序。先测其中的...
高通量测序
中,read、contig和Scaffold分别是什么
答:
1.什么是Reads?
高通量测序
平台产生的序列就称为reads。2.什么是Contig?拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。3.什么是Scaffold?基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往还需要构建454 Paired-end库或Illumina Mate-pair库,以获得一定大小片段(如3Kb、6Kb...
什么是CLIP-seq?
答:
其主要原理是基于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀之后,回收其中的RNA片段,经添加接头、RT-PCR等
步骤
,对这些分子进行
高通量测序
,再经生物信息(bioinformation)学的分析和处理、总结,挖掘出其特定规律,从而深入揭示RNA结合蛋白与RNA分子的...
高通量测序的
介绍
答:
高通量测序
技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
肿瘤rna检测是什么意思?
答:
肿瘤RNA检测的技术方法主要包括RNA提取、RNA测序及分析等
步骤
。首先,从患者的组织样本中提取RNA,并进行RNA质量分析和纯化。然后,利用RNA测序技术对RNA进行
高通量测序
,获得大量RNA序列信息。最后,通过RNA分析软件对RNA序列进行分析,得出肿瘤的RNA表达情况。整个
流程
需要耗费相当长的时间和资金成本。肿瘤RNA...
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