应收在院病人医疗款的主要账务处理如下：
（一）发生应收住院病人医疗款时，按照应收未收金额，借记本科目，贷记“医疗收入”科目。
（二）住院病人办理出院手续，结算医疗费时，如病人应付的医疗款金额大于其预交金额，应按病人补付金额，借记“库存现金”、“银行存款”等科目，按病人预交金额，
借：“预收医疗款”科目，按病人应付的医疗款金额，
贷：本科目。
如病人应付的医疗款金额小于其预交金额，应按病人预交金额，
借：“预收医疗款”科目，按病人应付的医疗款金额，
贷：本科目，按退还给病人的差额，
贷：“库存现金”“银行存款”等科目。
结转住院病人自负部分以外的应收医疗款、或结转病人结算欠费，按应收在院病人医疗款总额中扣除病人自负部分以外的金额，或病人结算欠费金额，
借：“应收医疗款”科目，
贷：本科目。