预防巨细胞包涵体病的主要手段是通过避免暴露。首先，医护人员在护理HCMV感染婴儿时，务必遵循标准预防措施，强调手部卫生至关重要。在使用血液制品时，应优先选择HCMV抗体阴性的产品，如洗涤红细胞。
阻断母婴传播是另一个关键环节。易感孕妇应避免接触已知排毒者的体液，尤其要注重个人卫生。对于携带病毒的母乳，除非婴儿早产或体重过轻，否则通常无需特殊处理。建议对这些特殊情况下婴儿的母乳，可在-15℃冰冻保存至少24小时后，室温下融化并进行短时巴斯德灭菌（72℃，5秒），以降低病毒活性。
药物预防在特定情况下也十分有效。对于骨髓移植和器官移植患者，可以采用更昔洛韦、缬更昔洛韦或伐昔洛韦等抗病毒药物。对于高危移植患者，可能推荐使用抗病毒药物结合静脉免疫球蛋白或高效价HCMV免疫球蛋白，剂量为100-200mg/kg，移植前后1-3周给予，持续60-120天。对于HCMV感染的早产儿，如果需要激素治疗且病情严重，可能需要考虑使用GCV或VGCV进行预防性治疗。
尽管HCMV疫苗的研究已超过30年，但至今仍无有效疫苗投入临床使用，特别是在母婴传播方面的预防措施上还有待突破。当前的研究仍在继续，希望能早日填补这一领域的空白。
巨细胞包涵体病又称巨细胞病毒感染，是由人巨细胞病毒感染所导致的一种先天性或后天性全身感染性疾病。由于在被感染的很多器官组织内可以发现细胞核内和胞浆内的人巨细胞病毒包涵体而被称为巨细胞包涵体病。近年来，随着分子生物学技术的发展，巨细胞病毒活动性感染的诊断不再依赖于病理发现组织细胞的病毒包涵体，因此，巨细胞包涵体病多被称为巨细胞病毒感染。