近年来，体育科学学院的发展突飞猛进，各项工作硕果累累，。1998年，获得了“体育教育训练学”硕士学位点。1999年，开办“社会体育”新专业，实现了一个专业向两个专业的跨越。2000年，获得了“课程与教学论”（体育课程与教学论方向）博士生培养资格。2001年，获得“教育硕士”（体育）授权点资格、被教育部授予“国家体育与艺术师资培养培训基地”。2002年，获全国体育教育专业大学生基本功大赛一等奖第一名。2003年，获“体育人文社会学”硕士学位点、并被国家体育总局授予“国家体育社会科学重点研究基地”。2004年，有四篇论文入选雅典奥运科学大会、一篇论文入选亚洲体育论坛、17篇论文入选全国第七届体育科学大会、6篇论文入选全国第四届大学生运动会体育科学论文报告会。2005年成功申报“体育人文社会学”博士点、“体育学一级学科”硕士点和“运动人体科学”硕士点；“社会体育本科专业”获得学士学位授予权；体育教育专业为省首家开办“体育自考”的单位。2006年田雨普教授获年度国家体育总局科技进步奖一等奖。2007年有19篇论文入选全国第八届体育科学大会，等等。
在学科建设方面成效显著，已经形成了博士、硕士、教育硕士、本科、体育继续教育相衔接的多层次办学的格局。建成了通修课程、平台课程、专业课程和自主发展课程模块化课程体系，构建了必修、必选、任选相配合、多学科交叉、理论与实践渗透的较为完善的学科体系。
在师资队伍建设方面卓有成效，。
在科学研究方面成果丰硕，省优秀教学成果一等奖2项，校级的教学奖、教材奖、育人奖、双优奖、优秀讲义奖20余项。出版教材、专著32部，发表论文1000余篇，展现了学院教师良好的精神风貌、工作热情、科学态度和学术水平。
围绕学校创建综合性有特色的教学研究型大学的目标，南京师范大学体育科学学院在当前的发展规划中，将坚持内涵提升与外延拓展协调发展、走可持续发展的道路，努力解决好教师目标定位问题，处理好办学规模、结构、质量、效益的关系，以人为本、努力提高本科生和研究生培养质量。
