第1个回答 2013-08-30
TV
001 云霄飞车杀人事件
013 奇怪的寻亲杀人事件
054 电玩公司杀人事件
118 浪花连续杀人事件
128 黑暗组织10亿元抢劫事件
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
230 迷一样的乘客（前篇）
231 迷一样的乘客（后篇）
272 急忙掩饰的忽略(后篇)
286 工藤新一纽约事件（事件篇）
287 工藤新一纽约事件（推理篇）
288 工藤新一纽约事件（解决篇）
289 光彦森林迷失记（前篇）（邵渊己一郎出场）
290 光彦森林迷失记（后篇）
307 没有声音的证词（前篇）
308 没有声音的证词（后篇）
309 与黑暗组织接触（交涉篇）
310 与黑暗组织接触（追击篇）
311 与黑暗组织接触（决死篇）
338 四辆保时捷（上）
339 四辆保时捷（下）
340 厕所隐藏的秘密（前篇）
341 厕所隐藏的秘密（后篇）
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音 前奏曲
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音 尾奏曲
394 奇妙房屋的大冒险（封印篇）
425 黑色冲击！黑暗组织魔爪伸来的瞬间
427 充满神秘的上学之路（前篇）
428 充满神秘的上学之路（后篇）
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
510 柯南VS W暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
542 让鱼儿消失的一角岩(前篇)
543 让鱼儿消失的一角岩(后篇)
563 侦探团VS强盗团(骚乱)
564 侦探团VS强盗团(沉默)
578 召唤危机的红色凶兆
579 黑与13的暗示
580 逼近黑色时刻
581 红色飘摇的目标
2001 剧场版5：通往天国的倒计时（天国へのカウントダウン）2001/04/11
2009 剧场版13：漆黑的追迹者（漆黒の追迹者） 2009/04/18 求接纳
第2个回答 2019-01-26
001云霄飞车杀人事件(变小)
005
新干线大爆破事件
043江户川柯南诱拐事件(父母知道变小)
048~049外交官杀人事件(平次登场，第一次恢复)
054
电玩公司杀人事件
230~231
诡密的乘客(扮成新出医生的贝尔摩)
057~058福尔摩斯迷杀人事件(平次知道身份)
128黑暗组织10亿元抢劫事件
129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件(哀登场)
176~178
与黑暗组织的再会
188~193
危命的复活
(哀研制出实验药品，新一短暂恢复)
219
名侦探的会集！新一vs怪盗KID
(KID知道新一身份)
258~259
来自芝加哥的男子(FBI头头登场)
284~285中华街雨中的似曾相识
286~288工藤新一NY事件(这几集是小兰的回忆，和秀一以及贝尔摩第一次见面)
307~308
遗留下来的无声证言(发现黑暗组织的线索)
309~311
与黑暗组织的接触
340~341
厕所隐藏的秘密
345
直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件
425
黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场，小五郎受到怀疑，若不是秀一就挂掉了)
加上491
红与黑的碰撞
开始
492
红与黑的碰撞
血缘
493
红与黑的碰撞
疾呼
494
红与黑的碰撞
冥土
495
红与黑的碰撞
昏睡
496
红与黑的碰撞
入侵
497
红与黑的碰撞
觉醒
498
红与黑的碰撞
搅乱
499
红与黑的碰撞
伪装
500
红与黑的碰撞
遗言
501
红与黑的碰撞
嫌疑
502
红与黑的碰撞
洁白
503
红与黑的碰撞
决死
504
红与黑的碰撞
殉职
509
红白黄色与侦探团
剧场版
2001
剧场版5：通往天国的倒数计时
(天国へのカウントダウン)
是这样吧
2009剧场版13:
漆黑的追逐者(漆黒の追迹者)
第3个回答 2013-08-30
1 云霄飞车杀人事件
54 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
230 神秘的乘客（前篇）
231 神秘的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇）
289 光彦森林迷失记（前篇）*
290 光彦森林迷失记（后篇）*
307 遗留的无声证言（前篇）
308 遗留的无声证言（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追迹篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所里隐藏的秘密（前篇）
341 厕所里隐藏的秘密（后篇）
345 与黑衣组织的直面对决 满月之夜的双重谜案
425 黑色冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色与13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
667 婚礼前夜（前篇）*
668 婚礼前夜（后篇）*
671 侦探们的夜想曲（案件）*
672 侦探们的夜想曲（绑架）*
673 侦探们的夜想曲（推理）*
674 侦探们的夜想曲（波本）
681 以性命为赌注的恋爱转播（转播开始）*
683 以性命为赌注的恋爱转播（现场突入）*
699 逼近灰原秘密的黑影（前篇）*
700 逼近灰原秘密的黑影（后篇）
701 漆黑的特快列车（发车）
702 漆黑的特快列车（隧道）
703 漆黑的特快列车（交叉）
704 漆黑的特快列车（终点）
705 密室中的柯南 *
706 解谜的波本
162 飞天密室！工藤新一最初的事件★（兰睡梦中的回忆，新一首次协助警方破案）
190 危命的复活 第三种选择（平次假扮，后被揭穿。真新一扮成黑衣骑士出现在舞台，未交待身份）
191 危命的复活 黑衣骑士（变回来的）
192 危命的复活 新一回来了（药效没过）
193 危命的复活 约定的场所（药效没过，但在结尾过了）
219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德★（怪盗基德的回忆，此故事改编自《魔术快斗》漫画
286 工藤新一NY事件（事件篇）（回忆，发生在TV 162回忆部分之后）
287 工藤新一NY事件（推理篇）（回忆）
288 工藤新一NY事件（解决篇）（回忆）
521 杀人犯 工藤新一★（照片、回忆、诚人整容）
522 新一的真实身份和兰的眼泪★（回忆、诚人整容、服药恢复）
523 真正想问的事（服药恢复）
616 福尔摩斯的默示录（名侦探的弟子）（服药恢复）
617 福尔摩斯的默示录（Love is 0）（服药恢复）
618 福尔摩斯的默示录（撒旦）（服药恢复）
621 福尔摩斯的默示录（0 is start）（兰的回忆、服药恢复）
第4个回答 2018-05-06
TV 版
注：带★表示动画特别篇；带*表示虽然有黑衣组织的成员登场，但是与黑衣组织本身无太大关联。括号内表示海外版集数。
1（1） 云霄飞车杀人事件
54（56） 电玩公司杀人事件
118（124~125）浪花连续杀人事件★ *
128（135）黑衣组织十亿元抢劫事件（部分情节为动画原创）
129（136~139）来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★
176（190）与黑衣组织的再会（灰原篇）
177（191）与黑衣组织的再会（柯南篇）
178（192）与黑衣组织的再会（解决篇）
230（249）神秘的乘客（前篇）
231（250）神秘的乘客（后篇）
271（293）急忙掩饰的忽略（前篇）
272（294）急忙掩饰的忽略（后篇）
286（308）工藤新一纽约事件（事件篇）
288（310）工藤新一纽约事件（解决篇）
289（311）光彦森林迷失记（前篇）*
290（312）光彦森林迷失记（后篇）*
307（332）遗留的无声证言（前篇）
308（333）遗留的无声证言（后篇）
309（334）与黑衣组织的接触（交涉篇）
310（335）与黑衣组织的接触（追迹篇）
311（336）与黑衣组织的接触（决死篇）
338（363）四辆保时捷（前篇）
339（364）四辆保时捷（后篇）
340（365）厕所里隐藏的秘密（前篇）
341（366）厕所里隐藏的秘密（后篇）
345（371~375）与黑衣组织的直面对决 满月之夜的双重谜案★
425（459~463）黑暗冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间★
462（502）黑衣组织的影子 年幼的目击者
463（503）黑衣组织的影子 奇妙的照明
464（504）黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465（505）黑衣组织的影子 珍珠的流星
484（527）黑色照片的去向（前篇）
485（528）黑色照片的去向（后篇）
491（538）红与黑的碰撞 开端
492（539）红与黑的碰撞 血缘
493（540）红与黑的碰撞 绝叫
494（541）红与黑的碰撞 冥土
495（542）红与黑的碰撞 昏睡
496（543）红与黑的碰撞 侵入
497（544）红与黑的碰撞 觉醒
498（545）红与黑的碰撞 搅乱
499（546）红与黑的碰撞 伪装
500（547）红与黑的碰撞 遗言
501（548）红与黑的碰撞 嫌疑
502（549）红与黑的碰撞 洁白
503（550）红与黑的碰撞 决死
504（551）红与黑的碰撞 殉职
563（614）侦探团VS强盗团（骚动）
564（615）侦探团VS强盗团（沉默）
578（629）召唤危机的红色前兆
579（630）黑与13的暗示
580（631）逼近的黑色时刻
581（632）红色的摇摆目标
667（719）婚礼前夜（前篇）*
668（720）婚礼前夜（后篇）*
671（723）侦探们的夜想曲（案件）*
672（724）侦探们的夜想曲（绑架）*
673（725）侦探们的夜想曲（推理）*
674（726）侦探们的夜想曲（波本）
681（733）以性命为赌注的恋爱转播（转播开始）*
683（735）以性命为赌注的恋爱转播（现场突入）*
699（751）逼近灰原秘密的黑影（前篇）*
700（752）逼近灰原秘密的黑影（后篇）
701（753）漆黑的特快列车（发车）
702（754）漆黑的特快列车（隧道）
703（755）漆黑的特快列车（交叉）
704（756）漆黑的特快列车（终点）
705（757）密室中的柯南 *
706（758）解谜的波本
722（774）香甜冰凉的快递（前篇） *
723（775）香甜冰凉的快递（后篇） *
734（786~787）茱蒂的追忆与赏花的陷阱★
739（792）小五郎在酒吧里（后篇）
740（793）小兰也倒在浴室里了（前篇）
770（823）气氛僵硬的茶会（前篇）
771（824）气氛僵硬的茶会（后篇）
779（832）绯色的序章
780（833）绯色的追寻
781（834）绯色的交错
782（835）绯色的回归
783（836）绯色的真相
813（868） 悄悄靠近安室的黑影
836（891） 关系不好的女子乐队（前篇）*
837（892） 关系不好的女子乐队（后篇）*
漫画版
注：三个数字分别表示卷数、话数和总话数，如“01/01 001”表示“第1卷第1话，总第1话”。带*表示虽然有黑衣组织的成员登场，但是与黑衣组织本身无太大关联。
01/01 001 现代的福尔摩斯
01/02 002 变成小孩子的名侦探
02/04 014 行踪不明的男子
02/05 015 可怜的少女
02/06 016 追踪高大的男人
02/07 017 恶魔一样的主谋
04/04 033 黑色公事包之谜（对应动画修改为与组织无关）
12/04 114 突如其来的遭遇
12/05 115 炸弹的下落
12/06 116 柯南失算了
18/06 176 转学生
18/07 177 黑衣女郎
18/08 178 秘密组织成员·代号雪莉
18/09 179 伪装的少女
18/10 180 将死
19/01 181 为什么？
19/09 189 被狙击的球！
19/10 190 5万6千名人质
20/01 191 远方之眼
24/07 238 背叛的街角
24/08 239 漆黑的丧葬行列
24/09 240 不告而别
24/10 241 来自过去的子弹
24/11 242 白色世界
29/03 287 看不见的恐怖
29/04 288 危险讯号
29/05 289 光天化日下的埋伏
34/11 350 金苹果①
35/01 351 金苹果②
35/02 352 金苹果③
35/03 353 金苹果④
35/04 354 金苹果⑤
37/05 377 黑暗的足迹①
37/06 378 黑暗的足迹②
37/07 379 黑暗的足迹③
37/08 380 白雪…黑影…
37/09 381 危险的相遇
37/10 382 顺风车
38/01 383 新兵器！
41/10 423 到访者留下的谜
41/11 424 小小密室的秘密
42/01 425 隐藏的真相
42/05 429 月圆之夜和黑宴
42/06 430 染血的幽灵船
42/07 431 隐形人出现
42/08 432 工藤新一登场
42/09 433 面具下的真相
42/10 434 腐坏的苹果
46/07 475 封印
48/09 499 门铃怪客
48/10 500 新黑衣人
49/01 501 追踪目标
49/02 502 新的指令
49/03 503 黑衣组织vsFBI ①
49/04 504 黑衣组织vsFBI ②
53/07 550 目击者一人
53/08 551 钉子与蛇
53/09 552 锤子的真面目
53/10 553 不可思议的兼职
54/01 554 晚餐的菜单
54/02 555 梦中之星
57/09 595 乌鸦之歌
57/10 596 第二条线
57/11 597 假患者
58/01 598 跟踪，然后……
58/02 599 赤井的过去
58/03 600 孤注一掷
58/04 601 伪装
58/05 602 最终手段
58/06 603 任务
58/07 604 姐弟
58/08 605 意外的嫌疑人
58/09 606 13日又是星期五
58/10 607 卡迈尔的过去
58/11 608 魔法的咒语
59/01 609 钢楔
60/03 622 红白黄色
60/04 623 黑白君
60/05 624 新邻居
64/01 664 一角岩
64/03 666 杀气
65/03 677 命运之人
65/04 678 陷阱
65/05 679 摇摆的心
65/06 680 与危险的二人同行
67/03 699 期待明天
67/04 700 危险地带
67/05 701 赤与13的暗示
67/06 702 炸弹犯的目的
67/07 703 暴风雪中的真相
67/08 704 寂静的战争
72/04 755 通话代码
74/02 775 视频网站
74/03 776 罐子和猫
74/04 777 步美的痕迹
75/09 793 私家侦探 *
75/10 794 遗传信息 *
75/11 795 回归于火焰的命运 *
76/01 796 相约科伦坡 *
76/02 797 错综复杂的谎言与谜题 *
76/03 798 侦探们的夜想曲 *
76/04 799 小孩的好奇心和侦探的探究心 *
76/05 800 立体交错的思绪
76/06 801 完全不笑的人
76/07 802 别摆出那副表情
76/09 804 高木警官送来的礼物 *
77/02 808 迟到的扫墓 *
77/09 815 自己的地盘
77/11 817 灯下的孤影
78/01 818 神秘列车（启程）
78/02 819 神秘列车（隧道）
78/03 820 神秘列车（一等）
78/04 821 神秘列车（交叉）
78/05 822 神秘列车（拦截）
78/06 823 神秘列车（冒烟）
78/07 824 神秘列车（终点）
78/08 825 特别教练 *
78/09 826 消失的密室钥匙 *
78/10 827 解谜的钥匙
80/03 842 猫咪快递 *
80/04 843 送往工藤家的快递 *
80/11 850 波本的目的
81/01 851 茱蒂的追忆 *
81/02 852 赤井秀一的消息
81/05 855 侦探在酒吧解决案件
81/06 856 外遇调查
82/04 865 三色猫大尉 *
82/05 866 猫着真心 *
84/06 888 气氛僵硬的茶会
84/07 889 零
84/08 890 高速飞溅的血迹
84/09 891 最后的一片
84/10 892 从我的日本离开…
84/11 893 波本的追究，绯色的序章
85/01 894 绯色的疑惑
85/02 895 绯色的讯问
85/03 896 绯色的回归
85/04 897 绯色的真相
85/05 898 绯色的尾声
88/11 937 消失的线索*
89/01 938 死角处的罪行
953 宛如暗鬼不明真身
954 背叛的制裁
955 背叛的去向
956 背叛的矛头
957 背叛的真相