国务院部委管理的国家局机构设置主要包括以下几个方面：
1. 国家信访局：负责国内群众和境外人士的来信来访处理，保证信访渠道畅通，并对重要建议、意见和问题进行综合分析，提出相关政策建议，协调跨地区、跨部门的信访问题。
2. 国家粮食局：作为国家发展和改革委员会下属机构，负责全国粮食流通的宏观调控、行业指导和中央储备粮管理。
3. 国家能源局：主要负责能源发展战略、规划、管理石油、天然气、煤炭、电力等能源，以及新能源和节能政策的制定与国际合作。
4. 国家国防科技工业局：前身是国防科学技术工业委员会，负责组织管理国防科技工业的计划、政策和法规执行情况监督。
5. 国家烟草专卖局：1983年成立，实行统一领导的垂直管理体制，对全国烟草行业进行集中统一管理。
6. 国家外国专家局：主管国家智力引进，管理来华工作的外国专家和中国人员出国培训等工作。
7. 国家公务员局：负责公务员事务管理工作，从职位管理到培训监督，涵盖公务员事务的各个环节。
8. 国家海洋局：负责海洋规划、立法、管理和海域使用、环境保护，维护国家海洋权益。
9. 国家测绘地理信息局：归国土资源部管理，负责全国测绘事业的行政管理，包括法律法规制定和基础测绘规划等。
10. 中国民用航空局：主管民用航空事业，负责民航行业的宏观管理、法律制定和监督等。
11. 国家邮政局：代表国家参与国际邮政事务，负责邮政监管，建立覆盖城乡的邮政服务体系。
12. 国家文物局：负责机关内部管理和对外交流工作，以及文物和博物馆业务统计。
13. 国家食品药品监督管理局：负责药品和食品保健品安全管理的监督和技术工作。
14. 国家中医药管理局：管理中医药行业，研究拟定中医药发展方针和政策。
15. 国家外汇管理局：负责外汇管理，包括国际收支、资本项目等事务。
16. 国家煤矿安全监察局：负责煤矿安全生产的政策制定和监管工作，确保矿井安全。
17. 国家保密局：负责政府内部文档保密及涉密案件查处等工作。
18. 国家密码管理局：管理和保护国家密码工作的机密资料。
19. 中国国家航天局：执行国家航天政策，负责中国的航天事业。
20. 国家原子能机构：负责和平利用原子能事业的政策和法规制定，发展规划等工作。
21. 国家语言文字工作委员会：负责汉语文字的规范化、标准化和执行文字使用政策。
22. 国家核安全局：负责核安全、辐射安全和环境管理的监管，曾并入国家环保总局。