同济大学作为同科学院的依托，凭借其深厚的师资力量、全面的学科覆盖和严谨的管理，确保了学院的教育质量与水平。上海同济科技实业股份公司的合作为其提供了强大的经济支持，确保了资金和资源的有效投入，同时也引入了富有活力的管理机制，积极参与学院的决策与监督。
同科学院采用创新的运营模式，借鉴德国科技大学的培养模式，以培养技术应用型本科人才为核心目标，以提升技术应用能力为主线，强调产学研一体化和校企深度合作。学院根据市场需求，以工科为主导，开设文、经、管、医、艺术等多元专业，旨在满足上海及长三角地区对高层次技术人才的需求，逐渐形成鲜明的办学特色。
学院坚持以科学发展观为指导，致力于现代教育理念和办学策略的实施，注重市场导向，依托同济大学的底蕴，独立办学，实现特色发展，追求教育质量。学院倡导创新教育理念，改革培养模式，强化实践环节，实施全面素质教育，致力于培养适应生产、管理、服务等领域的应用型、技术型和个性化人才。
同科学院积极拓展国际教育交流，与德国、澳大利亚等国家的高校开展合作与学生交流项目，推动国际化教育进程，促进国际合作办学的深化。
在2006年，同科学院计划设立八个专业，涵盖理工、文、管理、医学等多个领域，以满足不同学生的学习兴趣和志向，招生对象主要为上海的高中生，采用全日制教育，学院提供舒适的公寓宿舍，提供社会化服务。
由同济大学与上海同济科技实业股份有限公司合作创办、四年制本科层次的独立学院——“同济大学同科学院”，2006年5月18日下午在同济大学沪北校区揭牌成立，同年年计划在沪二本招生297名。上海市教委副秘书长蒋红、我校党委书记周家伦到会致辞并共同为同科学院揭牌，闸北区副区长韩晓玉、我校副校长陈小龙也分别致辞。揭牌仪式结束后，校领导与市教委相关职能部门负责人还就同科学院的实际运作和今后发展进行座谈研讨。