苏州河环境综合整治一期工程取得了显著的成果，实现了市政府设定的目标。
一、水质提升至景观标准
经过严格的截污治污措施，苏州河干流的水质得到了显著改善。2002年，武宁路桥断面的水质数据显示，CODCr、BOD5和DO等主要指标已基本达到国家景观用水标准（Ⅴ类水），与1998年相比，水质大幅改善，DO浓度翻了一番，CODCr、BOD5和NH3-N浓度下降超过60%，这表明河流生态系统的恢复正在逐步推进。
二、生态系统恢复显现生机
随着水质改善，河道生态系统也有所恢复。在污染严重的武宁路桥断面，昆虫幼虫的出现标志着生命的回归。下游生物多样性增加，游着生动物种类数增加近50%，多样性指数上升，表明水质已从重污染恢复到中污染水平。底栖动物生物量显著增加，如武宁路桥断面的生物量增长了300%，底栖动物种类也发生变化，出现了清洁指示种。
三、市区六支流截污率提升
市政府和区级政府的共同努力使得苏州河市区六支流的截污率超过75%，彭越浦、木渎港和新泾港等曾为污染重灾区的河流水质得到了改善。
四、水系旱天黑臭问题减轻
虹口港和杨树浦港的水系通过实施调水和提高截污率，旱天黑臭现象基本消除，水体质量得到了明显提升。
五、两岸环境改善
通过拆除脏乱差区域的环卫码头，并建设了10公里长的绿化带，绿化面积达到16万平米，河岸环境有了显著的改观。
苏州河是吴淞江进入上海市区段的俗称。在任何正规文件中，苏州河的大名还是叫做吴淞江。 据上海市档案馆研究员马长林介绍，苏州河属于太湖水系，上海开埠前，苏州河一直叫吴淞江，只是上海开埠后，由于外国人发现可以乘船从这条河到苏州，所以叫它为苏州河。但是中国官方资料一直叫这条河为吴淞江，所以吴淞江这个大名一直没有改变。不过根据习惯，以北新泾为界，吴淞江上游称为吴淞江，当地百姓也是这么称呼的，而北新泾以东为吴淞江下游，进入上海市区，上海人称之苏州河。