南京师范大学体育科学学院在近年来取得了显著的发展，各项成绩斐然。1998年，学院成功获得了“体育教育训练学”硕士学位点，为学科建设奠定了坚实基础。紧接着，1999年增设了“社会体育”专业，标志着学院的专业领域拓宽至两个方向。2000年，学院又取得了“课程与教学论”（体育课程与教学论方向）的博士生培养资格，进一步提升了科研实力。
2001年，学院获得了“教育硕士”（体育）授权点，同时被教育部认定为“国家体育与艺术师资培养培训基地”。2002年，学院在体育教育专业大学生基本功大赛上荣获一等奖第一名，展示了其在人才培养上的卓越成绩。2003年，学院又新增了“体育人文社会学”硕士学位点，并被国家体育总局授予“国家体育社会科学重点研究基地”称号。
至2004年，学院的研究成果硕果累累，有多篇论文分别入选雅典奥运科学大会、亚洲体育论坛、全国第七届体育科学大会和全国第四届大学生运动会体育科学论文报告会。2005年，学院成功申报了多个学位点，如“体育人文社会学”博士点和“体育学”、“运动人体科学”硕士点，同时“社会体育”本科专业也获得了学士学位授予权。同年，体育教育专业成为全省首个开展体育自考的单位。
2006年，田雨普教授的科研成果荣获国家体育总局科技进步奖一等奖，进一步提升了学院的科研影响力。2007年，学院在科研方面的贡献继续增长，19篇论文入选全国第八届体育科学大会。
学院在学科建设上已经形成了多层次的办学体系，包括博士、硕士、教育硕士、本科和体育继续教育等，构建了课程模块化、学科交叉和理论实践结合的完善体系。师资队伍建设方面，学院培养了一支专业素质高、热情敬业的教师队伍，屡获教学成果奖项。
以创建综合性有特色的教学研究型大学为目标，南京师范大学体育科学学院正在规划中，致力于内涵提升与外延拓展的协调发展，追求可持续发展，重视教师目标定位，平衡办学规模与质量，坚持以人为本，致力于提高本科生和研究生的培养质量。
南京师范大学体育科学学院的前身南京师范大学体育系历史悠久，其渊源可追溯到1925年，当时的金陵女子文理学院创建了体育系。学院现有教授15人，副教授37人，博士生导师4人，硕士生导师21人，专任教师中有博士学位11人、在读博士5人、硕士23人、在读硕士10人，出国访问学者9人，国际级裁判3人，国家级裁判12人，一级裁判15人，有5人享受政府特殊津贴，3人获曾宪梓师范教育奖。有国家级科研课题8项，省部级课题10项，厅局级课题20项，科研经费180多万元。国家优秀教学成果奖1项，