免疫抑制剂主要分为五类：糖皮质激素（如可的松、强的松）、微生物代谢产物（如环孢菌素、藤霉素）、抗代谢物（如硫唑嘌呤、6-巯基嘌呤）、单克隆和多克隆抗淋巴细胞抗体（如抗淋巴细胞球蛋白、OKT3）以及烷化剂（如环磷酰胺）。
根据合成方式，免疫抑制剂大致可分为四类：微生物酵解产物如环孢菌素（CsA）、他克莫司（Tacrolimus）、雷帕霉素衍生物等；完全有机合成物如抗肿瘤药物，如烷化剂（如环磷酰胺）、抗代谢药（如硫唑嘌呤、氨甲蝶呤等）；半合成化合物如RS61443（MMF）、SDZIMMl25等；生物制剂如抗胸腺细胞球蛋白（ATG）、抗淋巴细胞球蛋白（ALG）。
按照发展进程，免疫抑制剂分为四代：第一代以肾上腺皮质激素如强的松、雷公藤多苷片等为代表，第二代以环孢素（环孢菌素A、他克莫司）为代表，阻断IL-2合成；第三代以雷帕霉素、霉酚酸脂（MMF）抑制免疫信号通路；第四代如抗IL-2受体单克隆抗体，针对特定Cytokine调控。
临床应用方面，免疫抑制剂分为预防性用药（如CsA、FK506、MMF、Aza、Prednisone）、救治用药（如甲基强的松龙、MMF、FK506等）和诱导性用药（如ATG、OKT3、Simulect等，针对特定情况如延迟肾功能、高危病人等）。
免疫抑制剂是对机体的免疫反应具有抑制作用的药物，能抑制与免疫反应有关细胞（T细胞和B细胞等巨噬细胞）的增殖和功能，能降低抗体免疫反应。 免疫抑制剂主要用于器官移植抗排斥反应和自身免疫病如类风湿性关节炎、红斑狼疮、皮肤真菌病、膜肾球肾炎、炎性肠病和自身免疫性溶血贫血等。