百色市公安局内设机构分工明确，各司其职，确保了公安工作的高效运行。以下是各部门的主要职责：
办公室（外事办公室）: 主要负责调查研究、公安工作信息的收集与发布，起草重要文件和会议材料，组织会务工作，以及统计和文档管理工作。同时，负责外事交往和群众来访控告申诉的处理。
纪律检查委员会、监察室: 负责党纪检查、党风廉政建设和反腐倡廉工作，监察全市公安机关的工作，处理纠风、监察信访等事务。
政治部: 关注队伍建设，负责警察录用审核、机构编制人事管理，以及考核、评优、警衔晋升等工作。同时，负责教育培训、警体工作和绩效考评的组织协调。
指挥中心: 协助领导处理大型活动安保、重大事件处置和紧急警务，负责110报警服务台的整合工作。
警务督察支队: 督察全市公安工作执行情况，维护民警执法权益，管理督察文书、证件和标志，进行现场督察。
经济犯罪侦查支队: 主要负责重特大经济犯罪和涉外经济犯罪的侦查，研究犯罪动态，制定防范策略，指导全市经侦业务和信息化建设，进行警员培训，并与其他执法部门合作打击经济犯罪。