1、肝肾的损害，尤其老年人的肝功能、肾功能较比年轻人就已经有不同程度的下降。部分药物通过肾排泄，部分抗生素是通过肝代谢，所以几乎所有的抗生素对肝和肾都或多或少有一定的损害。
2、肠道菌群的紊乱，众所周知抗生素滥用或者长期服用一种抗生素，会导致肠道菌群的紊乱，造成腹泻、不可抑制的水样便等。这个时候需要立即停止抗生素的使用，重新建立肠道菌群。另外比较致命的副作用就是过敏的反应，一旦出现会危及生命，这个时候需要及时地给予处理。
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注意事项：
1、敏体质慎用抗生素，对过敏的禁用。
2、肝功能不全慎用大环内酯类、磺胺类和抗结核、真菌药。后两者长期使用时，应定期复查肝功能。头孢菌素类剂量较大时也可损坏肝功能。
3、老、幼用户避免使用庆大霉素、链霉素、卡那霉素等肾毒性、耳毒性药物。
4、磺胺类药抑制甲状腺功能，故甲状腺功能低下者禁用。
5、中药制剂双黄连口服液、穿心莲片、冬凌草片、金莲花冲剂，草药野菊花、金银花、连翘、蒲公英、黄芩等，更适用于非化脓性上呼吸道感染，副作用较小。
6.无明确感染征象，应尽量避免使用抗生素，防止产生耐药性(细菌对药物的适应与抗药)及双重感染(敏感茵被杀灭后，不敏感菌因失去拮抗而感染机体)。
参考资料来源：