1. 办公室: 负责全旗司法行政系统的综合研究，制定工作计划和规划，组织重大政务活动，协调各股室工作，负责应急指挥和文件管理，负责内外事务、会务接待，以及统计、纪检监察、计划生育、扶贫、综合治理和政务公开等工作。此外，还负责司法行政装备和警用车辆、通讯物资的管理，以及机关财务工作。
2. 政治办公室: 关注司法行政队伍的思想政治建设，指导教育和宣传工作，负责表彰奖励和干部考核，管理机构编制和人事调配，参与专业技术资格工作。
3. 法制宣传股: 主导法制宣传教育和普法工作，制定实施规划，指导普法活动，负责法制建设的检查和总结，管理普法刊物和网站，处理行政复议和应诉工作，参与法学理论研究和执法监督。
4. 律师公证工作股: 监督和管理全旗律师、公证工作，制定和执行相关法规，对律师机构和执业人员进行审核和管理，确保法律服务市场的规范运行，指导律师和公证业务。
5. 基层工作股: 指导基层司法行政工作，包括司法所管理、社会矛盾调解、安置帮教和法律服务等，负责刑释解教人员安置帮教工作的日常协调。
6. 法律援助工作股: 主导法律援助工作，传达和执行上级政策，制定工作规划，指导法律援助机构和工作人员，监督法律援助政策的执行，组织培训和案件质量检查。
7. 社区矫正工作股: 指导监督社区矫正工作，制定发展规划，协调各成员单位，处理具体工作问题，管理社区矫正对象，指导社区矫正队伍建设，以及对社区服刑人员的行政奖励工作。