吉林大学研究生院在学科建设方面表现出色，截至2009年，学校已拥有丰富的学位授权点资源。在一级学科博士学位方面，学校共批准了28个授权点，这些涵盖了195个二级学科，表明学校在高级学术研究领域有着深厚的底蕴。在硕士研究生教育上，研究生院提供了285个二级学科硕士学位授权点，为学生提供了广阔的学习选择。
在国家级学科排名中，吉林大学尤为瞩目。学校有一级学科国家重点学科，其中包括4个一级学科，覆盖了17个二级学科，显示出其在这些领域的领先地位。另外，学校还有15个二级学科被评为国家重点学科，显示出其在学术研究中的核心竞争力。值得一提的是，还有4个学科被列为国家重点（培育）学科，显示出学校对于新学科发展的重视和投入。
在博士后科研流动站方面，吉林大学同样表现出强大实力，拥有30个科研流动站，为优秀的博士后研究人员提供了优质的科研环境和资源，进一步推动了学校科研创新和人才培养。
吉林大学研究生院建于1984年6月，是经国务院批准的全国22所重点大学首批试办的研究生院之一。1996年3月，经原国家教委批准又成为首批正式建院的研究生院之一。 吉林大学研究生教育起步较早，1949年开始招收研究生班，1952年开始招收三年制研究生，1978年开始培养学位研究生。 1985年10月，经国务院批准，吉林大学成为首批建立博士后科研流动站的单位之一。