院所所有临床学科和生物医学工程一级学科均为博、硕学位授权点,设有临床医学博士后科研流动站,承担了博士后、博士、硕士、本科、大专5个层次12个专业的教学任务,年培养各类学员1000余名,年招收进修生500余名。院所具有良好的科研条件,为国家药品临床研究基地,拥有全军第一个国家重点实验室—创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室,全军“重中之重”建设实验室—战创伤基础研究实验室和全军重点实验室—交通医学实验室。高血压病实验室、创伤基础实验室、交通医学实验室、车辆生物安全碰撞实验室为重庆市重点实验室。
承担了以国家“973”、“863”、国家自然科学基金重点级为代表的重大科研课题,年获国家和省部级科研课题近百项。1979年以来,获得各类科研成果近400项,其中国家科技进步一等奖1项、二等奖6项,军队科技进步(医疗成果)一等奖10项、二等奖70项。重庆市科技进步一等奖3项,二等奖17项。每年发表学术论文600余篇,发表论文数及论文引用数均位居全国医院前20位,其中入选全国百篇优秀博士论文5篇。先后与美国、加拿大、法国、英国、德国、日本、澳大利亚等20多个国家的著名院校和医院建立了学术交流和科研协作关系,每年有100余人参与国际学术交流。