上海理工大学一共有6个校区:军工路校区(本部)、军工路南校区(原上海海洋大学校区)、浦东拱极路校区(原南汇区拱极路校区)、水丰路校区(上海理工大学上海出版印刷高等专科学校)、营口路校区(上海理工大学上海医疗器械高等专科学校)和复兴路校区(上海理工大学中英国际学院)。
军工路校区是校本部,除个别学院外的绝大多数学院本科生和研究生都在此。
营口路校区是原上海医疗器械高等专科学校,现在该校区还是专科生。2004年,上海理工大学合并了上海医疗器械高等专科学校,在军工路校区成立了医疗器械与食品学院,培养本科人才,营口路校区还是专科。
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