昌九城际铁路项目的历程始于2006年7月7日，这一天，压覆矿产评估报告得到了正式批复。随后，7月17日，地质灾害评估报告也顺利通过。接着，9月8日，环境影响评估报告和9月18日的水土保持方案也相继获得审批。同年10月，项目的初步设计经铁道部鉴定中心审查，通航论证报告在11月14日获得批准，防洪论证报告也在同月完成。
12月28日，最为关键的可行性研究报告得到了批复，标志着项目进入实质性的建设阶段。29日，建设用地预审报告也随之而来。2007年1月8日，江西省地方铁路建设集团公司提交了施工和监理招标计划，标段划分建议方案和工程招标文件初稿开始编制。3月，施工图编制工作顺利完成，项目建设正式启动。
5月，昌九城际铁路和向莆铁路在江西（香港）招商引资活动周上备受瞩目，江西地方铁路建设集团公司与大唐国际发电公司、加拿大万事达公司等企业签订了合作协议，共同推进铁路建设。6月28日，项目正式开工建设，进入实质性施工阶段。
2009年8月26日，昌九城际铁路全面铺轨，工程进度显著加快。2010年1月4日，铁路全线铺通。然而，建设并未在此时结束，2月，昌九城际铁路股份有限公司根据实际施工情况，对剩余工作进行了梳理，重新优化了施工组织设计，设定了明确的时间节点目标，将原计划的竣工日期提前至2010年6月30日，比原计划整整提前了5个月。
昌九城际高铁是中国第二条城际铁路，江西省第一条城际铁路——昌九城际铁路于2007年6月28日正式开工。作为继京津城际铁路交通建设后的全国第二条城际铁路，起点位于九江庐山站，出庐山站后沿京九铁路东侧而行，终点为南昌北站，并与现有的京九铁路相连，引入南昌站。昌九城际是具有世界级水准的高速铁路，也是中国《中长期铁路网规划》中投资规模较大、技术水平最高的一项工程。于2010年9月20日正式开通运营，昌九高铁自通车以来，因为它的快捷、舒适，已经成为民众往来的主要交通工具。