事业单位年终结余弥补以前年度亏损的注意事项及方法为：
经营结余的亏损不允许结转
本年度还是在经营结余科目里弥补
相关规定：《事业单位会计制度》（财会[2012]22号附件）
3403 经营结余
二（二）年末 如本科目为借方余额，为经营亏损，不予结转；
三 本科目期末如为借方余额，反映事业单位截至报告期末累计发生的经营亏损。
年末结账后，本科目一般无余额；如为借方结余，反映事业单位累计发生的经营亏损。
《收入支出表》
“弥补以前年度亏损后的经营结余”项目，反映事业单位本年度实现的经营结余扣除本年初未弥补经营亏损后的余额。本项目应当根据“经营结余”科目年末转入“非财政补助结余分配”科目前的余额填列；如该年末余额为借方余额，以“-”号填列。
“转入事业基金”项目，反映事业单位本年按规定转入事业基金的非财政补助结余资金。本项目应当按照本表中“本年非财政补助结余”项目金额减去“应缴企业所得税”、“提取专用基金”项目金额后的余额填列；如为负数，以“-”号填列。