当然有区别了，具体什么区别我不知道。但是我可以告诉你药用部位不一样的话由于其代谢环境不同，化学成分肯定有区别。
还是从中医说说吧。麻黄，地上部分药用，发汗解表；而麻黄根——就是其地下部分，药用是敛汗的，药效决然相反！如果用错会出人命的。再有板蓝根，十字花科菘蓝的根茎，其地上的叶子叫大青叶，药用也绝然不同。类似的还有何首乌对夜交藤，药效及来源自己去查。
只是要告诉你药用部位不一样不要随便吃。当然像杜仲这种中药还是要煮，不能代茶饮的。就好比喝粥要煮，而不拿大米沏茶一样。
说了一堆废话，没有解决您的实际问题，但希望对您有用
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