根据法律规定农民房有土地使用证，但需要自己提出申请，具体的方式如下：
1、向村委会写出书面申请。村委会根据村民大会讨论的意见，经村委会审查同意后，张榜公布，张榜七日无异议后，上报审批宅基地名单。
2、填写申请表：村委会同意后，由村负责填写《宅基用地呈批书》签署意见，村长签字，盖村委会公章。
3、乡镇政府审核：乡镇政府根据上报资料到现场进行勘测，经审查合格后，由国土资源所长签字、主管乡(镇)长签署意见并盖乡(镇)政府章，然后上报县国土资源局。
4、县国土资源局接件后，进行资料审核并到现场进行勘测。
5、审核、勘测合格后，报县政府进行审批。
6、审批后张榜公示7日无异议的，国土资源所到现场定点放线，准予开工建设。
7、建设完工后，报国土资源所验收。经验收合格后，由农房科组织相关材料发放《集体土地使用证》。
《中华人民共和国土地管理法实施条例》第三条，国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。