新疆医科大学第一临床医学院在科研方面取得了显著成果。医院现设有27个教研室，以及1个临床医学博士后流动站，涉及博士学位授予点包括临床医学一级学科、外科学和内科学－心血管，共有3个一级学科硕士点，涵盖了15个二级学科和33个三级学科。硕导队伍由141人组成，博导阵容有30人，研究生队伍在读硕士生651名，博士生32名。医院的教学楼承担着医护人员的技能培训和考核任务。
医院拥有多个自治区级研究所和质量控制中心，其中内科学和外科学被列为自治区重点学科。包虫病研究所的中心实验室更是自治区的重点实验室。医院积极推动学科整合，设立了宋庆龄（新疆）妇女儿童医院和心脏中心、骨科中心等，为不同疾病的研究和治疗提供了专门的中心。
医院注重科研与临床的紧密结合，通过搭建高技术研究与应用平台，关注器官移植、生殖助孕、干细胞治疗等领域，并针对新疆特发疾病如包虫病、食管癌和心脑血管疾病进行深入研究，实现原始创新，提升了医院的科研和诊疗水平，形成了“产、医、研”一体化发展模式。
借助新建的2万平方米科技楼和先进的科研管理模式，医院致力于营造积极的科研竞争氛围，通过设立科研专项基金和VIP研究平台，优化科研条件，打造留住和使用人才的长效激励机制。此外，医院积极与国内外科研机构合作，提升医疗、教学和科研水平，以期在自治区乃至全国范围内达到更高的科研基地和科研成果标准。
新疆医科大学第一临床医学院暨第一附属医院坐落于美丽的西部边城乌鲁木齐，是一所集医疗、教学、科研为一体的大型、综合性、现代化三级甲等医院。医院始建于1956年，是国家第一个五年计划中原苏联援助中国156个重点建设项目之一。