2000年：吴文俊，世界著名数学家，中国科学院院士；袁隆平，杂交水稻之父，籼型杂交水稻发明者，中国工程院院士。
2001年：王选，汉字激光照排系统创始人，中国科学院院士、中国工程院院士；黄昆，物理学家，中国科学院院士。
2002年：金怡濂 ，高性能计算机领域的著名专家，中国工程院院士。
2003年：刘东生，地球环境科学家，中国科学院院士；王永志，航天技术专家，中国工程院院士。
2005年：叶笃正，气象学家，中国科学院院士；吴孟超，肝胆外科学家，中国科学院院士
2006年：李振声，遗传学家，小麦远缘杂交的奠基人，中国科学院院士。
2007年：闵恩泽，石油化工催化剂专家，中国科学院院士、中国工程院院士；吴征镒，植物学家，中国科学院院士。
2008年：王忠诚，神经外科专家，中国工程院院士；徐光宪，化学家，中国科学院院士。
2009年：谷超豪，数学家，中国科学院院士；孙家栋，运载火箭与卫星技术专家，中国科学院院士。
2010年：师昌绪，金属学及材料科学家，中国科学院院士、中国工程院院士；王振义，内科血液学专家，中国工程院院士。
2011年：吴良镛，建筑与城市规划学家，中国科学院院士、中国工程院院士；谢家麟，加速器物理学家，中国科学院院士。
2012年：郑哲敏，著名力学家、爆炸力学专家，中国科学院院士、中国工程院院士；王小谟，雷达工程专家，中国工程院院士。
2013年：张存浩，物理化学家，中国科学院院士、第三世界科学院院士；程开甲，核武器技术专家，中国科学院院士，两弹一星元勋。
2014年：于敏，核物理学家，氢弹之父，中国科学院院士。
2016年：屠呦呦，药学家；赵忠贤，物理学家。
2017年：王泽山，火炸药专家；侯云德，病毒学家。
2018年：刘永坦，雷达与信号处理技术专家；钱七虎，岩石力学和防护工程专家。
2019年：黄旭华，核潜艇专家；曾庆存，大气科学家。
2020年：顾诵芬，新中国飞机设计大师、飞机空气动力设计奠基人；王大中，核能科学家。
关于最高科学技术奖
最高科学技术奖于2000年由中华人民共和国国务院设立，由国家科学技术奖励工作办公室负责。它是中国五个国家科学技术奖中最高等级的奖项，其他四个奖项包括国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科学技术进步奖和国际科学技术合作奖。
国家最高科学技术奖每年评选一次，每次授予不超过两名科技工作者。该奖项授予在当代科学技术前沿取得重大突破或者在科学技术发展中有卓越建树，以及在科学技术创新、科学技术成果转化和高技术产业化中创造巨大经济效益或者社会效益的科学技术工作者。获奖者由国家主席亲自签署、颁发荣誉证书、奖章和奖金，奖金数额为800万元人民币，全部由获奖者个人支配。
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