启东市招商局的历史发展可以追溯到2002年9月，当时市委市政府设立了"千人百团"领导组办公室，其办公地点设在市委办公大楼中，标志着招商局的初步设立。
2003年2月，根据启委发[2003]18号文件，成立了市大招商领导组办公室，同样设在市委办公地点，这进一步强化了招商工作的组织架构。
同年4月，根据启发[2003]32号文件，启东市招商局正式组建，作为市政府直属的正科级事业机构，与市大招商领导组办公室合署办公，这标志着招商局开始独立运作，办公地点依旧在市委办公室。
2005年7月，市招商引资领导小组办公室成立，与市对外贸易经济合作局共同办公，地点移至市外经贸局，这表明招商工作与对外贸易的融合进一步深化。
2006年2月，启委[2006]26号文件明确招商局为市政府直属的正科事业单位，并独立办公，办公地点再次调整回市委办公室，表明其地位的进一步稳固。
最后，在2010年1月，根据市级机关机构调整，市招商局成为商务局下属的二级局，其职责和职能在这一时期可能有所调整，但依然在为城市经济发展贡献力量。