这个肯定是不一样的，5S是苹果 A7+M7协处理器,1G运行内存，SE是苹果 A9+M9协处理器，2G运行内存，其它部分硬件就不说了，首先以上这些不一样，主板的布局肯定也不一样的。但是主板是可以换的。
具体的差别：
1、iPhone 5SE的电源键位被放在机身顶部；
2、屏幕外层覆盖2.5D弧形玻璃，效果类似iPhone 6；
3、iPhone 5SE的机身尺寸和iPhone 5S完全一致，后者三围是123.8×58.6×7.6mm；而根据之前曝光的情况来看，iPhone 5SE还将搭载A9处理器，提供1200万像素摄像头和2GB内存，运行iOS 9.3正式版，支持Apple Pay，提供Touch ID，有16GB和64GB版本，在金、银、灰的基础上新增玫瑰金。