奎文区发改局根据其职能设有多个内部科室，以支持和推动全区的经济发展和改革工作。以下是主要科室的职责概述：
办公室（挂改革综合科牌子）
负责协调日常事务，制定工作制度并监督实施；处理文电、会务、机要、档案等行政工作。
处理信访事项，管理党务群团、机构编制、人事和离退休人员事务，组织干部培训。
负责后勤保障，以及经济体制改革的综合协调和方案审批。
计划科
负责国民经济和社会发展规划的编制与评估，年度计划的编制与监督执行。
研究经济结构与产业发展政策，提出经济形势分析和调控建议。
关注农业、工业和国内外贸易，以及可持续发展、社会事业发展和高技术产业发展。
投资科
监测固定资产投资，编制中长期和年度计划，提出投资调控策略。
管理财政拨款项目，协调专项建设和政策性贷款使用。
负责重大项目和政府投资项目的稽察，指导招标投标工作。
研究外资发展战略，审批外资和境外投资项目，申报高新技术产业项目。