22问答网
所有问题
当前搜索:
16s测序及分析
为什么选用
16S
r RNA作为衡量生物进化的标尺
答:
16S
rRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中。因为
16s
rRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长(包含约50个功能域),所以是目前研究生物多样性和生物进化的一个特异性手段。特别的是高通量测序技术的发展,通过测序对16S rRNA区域进行
测序分析
可以用于分析环境中微...
基于细菌
16s
rdna
测序
的菌群
分析
一般可准确鉴定到何种分类水平
答:
种。但有时如果基因bank无有此种细菌的
16s
rdna数据,则也可能是鉴定到属。
16s
DNA关于细菌鉴定的详细问题
答:
1.分离DNA 2.用
16S
rRNA的保守序列做引物PCR 3.重复PCR得到大量16SrDNA 4.将得到的产物进行凝胶电泳 5.纯化分子量正确的PCR产物 6.Sanger
测序
7.将所得序列与数据库比较 8.鉴定结果
微生物高通量
测序
主成分
分析
能说明什么问题
答:
比如不同的
16S
rRNA序列的相似性高于97%就可以把它定义为一个OTU,每个OTU对应于一个不同的16S rRNA序列,也就是每个OTU对应于一个不同的细菌(微生物)种。通过OTU
分析
,就可以知道样品中的微生物多样性和不同微生物的丰度。
测序
区段:由于
16s
rDNA较长(1.5kb),我们只能对其中经常变化的区域...
扩增子,物种注释四部曲
答:
扩增子
测序
,如同探索微生物世界的微观地图,通过高通量技术揭示环境微生物的多样性和分布规律。今天,让我们一同揭开物种注释的神秘面纱,走进这四部曲的精彩篇章。一、代表性序列的精准分类首先,利用强大的usearch工具,对每个OTU的代表性序列进行精细的物种鉴定。
16S
、18S和功能基因默认采用RDP classifier的...
16S
rDNA序列
分析
时候什么有的文献使用了质粒载体扩增之后又一次进行PCR...
答:
其实从理论上来说质粒载体扩增之后又一次进行PCR扩增这是多此一举,但是在试验过程中这步省了直接PCR效果根本不好,以前我实验的时候做过……原因是载体可以使目的基因在宿主中低成本便捷的扩增,便于稳定保存目的基因,载体上有很多合适的酶切位点供选用,载体提供验证,如
测序
的方法 ...
请问
16s
rRNA在生物体中的功能是什么??
答:
一句话:
16S
rRNA序列在进化上是保守的,通常用来鉴定细菌等原核生物,并可进行进化
分析
。详细的:
16s
rRNA广泛存在于原核生物的细胞中,其分子长度约为1.5kb左右。 相比其他分子,16S rRNA既保证了较大的信息量(如5S rRNA太短, 包含信息量太少)又便于扩增和
测序
(23S rRNA较长,测序时比较麻烦)...
合成细菌
16s
rrna的酶有哪些
答:
16S
rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异,又能利用
测序
技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。[1]16S rRNA 编辑 原核生物的rRNA含有3种类型:23S、16S、5SrRNA,它们分别含有2,900、1540和120个核苷酸,23S核苷酸含量过多,几乎是16S核苷酸含量的两倍,
分析
...
高通量
测序
高质量细菌基因组是什么意思
答:
以
16s
rDNA扩增进行
测序分析
主要用于微生物群落多样性和构成的分析,目前的生物信息学分析也可以基于16s rDNA的测序对微生物群落的基因构成和代谢途径进行预测分析,大大拓展了我们对于环境微生物的微生态认知。目前我们根据16s的测序数据可以将微生物群落分类到种(species)(一般只能对部分菌进行种的鉴定),...
如何知道细菌的
16s
rRNA的完整序列
答:
提取细菌总DNA再用细菌
16s
rDNA通用引物PCR出16s序列,电泳找到所需条带,回收然后送到
测序
公司测序
棣栭〉
<涓婁竴椤
5
6
7
8
10
11
12
9
13
14
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜