血清脂肪酶是评价胰腺功能的又一重要指标。在体内，脂肪酶都是由胰腺分泌的，故对诊断胰腺疾病有一定特异性。在正常情况下，胰腺分泌的脂肪酶主要进入肠道，用于分解甘油三酯，而进入血液中的量很少。在急性胰腺炎发生时，由于胰腺细胞坏死或细胞通透性增高，此时胰腺分泌的脂肪酶进入血液中增多，因此，测定血清脂肪酶对诊断急性胰腺炎有参考价值，正常值为1 ～ 1.5 单位。
临床测定血清脂肪酶的主要目的是用于急性胰腺炎发作后期的诊断。急性胰腺炎发生时血清脂肪酶明显升高，它持续升高的时间比淀粉酶长，可达两周左右。当急性胰腺炎发作后期血清淀粉酶及尿淀粉酶已恢复正常时，测定血清脂肪酶对确诊急性胰腺炎有较大的价值。此外，血清脂肪酶升高亦可见于胆囊炎、胰腺癌、溃疡穿孔、肠梗阻等疾病，血清脂肪酶降低多见于慢性胰腺炎和家族性脂蛋白酶缺乏。
由于血清脂肪酶也受一些因素的影响，因此，在检测前应注意两方面的问题：一是抽血前至少应空腹8 小时，二是避免服用胆碱能药物（如山莨菪碱、混旋莨菪碱）、甲基吗啡、消炎痛、盐酸呱替啶和吗啡。