通含大气中二氧化碳浓度仅300毫克/升，虽然也能保证果树正常生育，但若人工增施二氧化碳，则会获得更高的产量。据测定，当二氧化碳浓度达300毫克/升时，光合率为10～20毫克CO2/（分米2·小时）；当二氧化碳浓度达1000毫克/升时，光合率为50～90毫克CO2/（分米2·小时），在一定范围内，二氧化碳浓度高，光合作用效率就高。
日光温室的密闭性强。严寒季节为了保温、蓄热，通风量小，通风时间短，有时甚至需要完全封闭，室内二氧化碳容易匮乏，尤其是那些有机肥施用量不足的温室。据测定，温室在密闭状况时，10时以后到14时二氧化碳浓度为100毫克/升，特别是12时左右，仅有75毫克/升。温室通风16时密闭以后，其二氧化碳浓度不断增加，18时是600毫克/升，20时是800毫克/升，22时以后则达1000毫克/升，这个浓度一直保持到次日清晨揭草苫之前，揭草苫以后，随着光合作用的进行，二氧化碳浓度急剧下降。一旦开窗换气后，很快与大气浓度持平，到了中午二氧化碳浓度又会降下来，低于大气的含量（图12）。但若遇低温阴雨，开窗很少，这种低浓度状态时间就会更长。
图12 日光温室二氧化碳日变化曲线图