可以抵扣。
一般纳税人建筑公司提供建筑服务取得收入，税率9%；购进材料取得增值税专用发票，按照发票上的税额抵扣。如果购进材料取得的增值税专用发票税率是13%，那么就可以按照发票上的税额抵扣的。
申请资料
纳税人应当向主管税务机关填报《增值税一般纳税人申请认定表》，并提供下列资料：
1、《税务登记证》副本。
2、财务负责人和办税人员的身份证明及其复印件。
3、会计人员的从业资格证明或者与中介机构签订的代理记账协议及其复印件。
4、经营场所产权证明或者租赁协议，或者其他可使用场地证明及其复印件。
以上内容参考：百度百科-一般纳税人
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