近亲（或称亲缘关系）是指三代或三代以内有共同的血缘关系。如果他们之间通婚，称为近亲婚配。他们双方有太多相似的遗传因子，后代无法从他们那里产生变异，有害基因将之传递给子孙。
如果这一基因按常染色体隐性遗传方式，其子女就可能因为是突变纯合子而发病。因此，近亲婚配增加了某些常染色体隐性遗传疾病的发生风险。近亲婚配使子女中得到这样一对纯合或相同基因的概率增加，这一相关系数称为近婚系数 。
由于近亲结婚的夫妇，双方有较多相同的基因，容易对生存不利的隐性有害基因在后代中传递（即纯合），因而容易出生素质低劣的孩子。据世界卫生组织估计，人群中每个人约携带 5 ～ 6 种隐性遗传病的致病基因。在随机婚配（非近亲婚配）时，由于夫妇两人无血缘关系，相同的基因很少，他们所携带的隐性致病基因不同，因而不易形成隐性致病基因的纯合体（患者）。而在近亲结婚时，夫妇两人携带相同的隐性致病基因的可能性很大，容易在子代相遇，而使后代遗传病的发病率升高。
因此，根据我国目前的人口形势和医疗水平，为了尽量减少近亲结婚造成的遗传缺陷，规定直系血亲和三代以内的旁系血亲禁止结婚。
1、近亲结婚违法
近亲结婚是违法行为，婚姻登记处是不会给办理结婚登记的，而且如果侥幸领了结婚证，后续被发现，也是属于无效婚姻的。
2、提高隐性遗传病的发病率
由于近亲结婚属于三代以内亲缘关系的结婚，那么在夫妻的体内所含有相似基因的概率就比两个非亲缘关系的人所含相似基因的概率要大得多。在这种情况下，所生出的后代所患有隐性遗传病的发病几率就要比正常的小孩高出数十倍甚至十数百倍。因此，在近亲结婚的情况下，后代的隐性遗传病发病情况将会是影响小孩健康的重要因素。
3、提高多基因遗传病的发病率
不仅仅隐性遗传病的发病率在近亲结婚的条件下会明显地高于正常情况，而且就连多基因遗传病的发病率也是如此。多基因遗传病包括先天性心脏病、无脑儿、脊髓裂变等，这些疾病在正常孩子身上的发病率为0.57%，在近亲结婚所生出的孩子身上的发病率为1.64%。由此我们可以看出近亲结婚对于多基因遗传病的诱发是极其明显的。
4、死亡率和畸形率较高
近亲结婚的后代除了有一些遗传性疾病之外，还会有畸形的现象发生。这些情况共同导致了这些孩子死亡率较高。
5、后代发育不良
近亲结婚的后代会有哪些不利影响呢？
通过对动植物的观察，发现近亲繁殖的有害后果包括生育率降低，身高减低和寿命缩减等不良影响。
在人类，近交繁殖会导致后代会出现更高的儿童死亡率、肺功能不良影响，和认知能力损害（傻孩子）等。
但是，这些结果基本上是来自粗略的印象观察，往往难以进行量化研究。
因为，既然近亲结婚是被禁止的，那么近交繁殖通常来自乱伦。
而乱伦属于犯罪行为，不会有人愿意将不仅涉及自己，还涉及后代的最隐秘的不良行为公诸于众，或与别人分享，即使对方再怎么承诺保密甚至签署隐私保密协议。
因此，进行近亲繁殖后代不良影响的研究具有极大的挑战性。
不过，分子生物学技术的发展，和基因数据库的建立似乎为这类研究开启了另一种可能。
最新发表在自然通讯上的一项大型研究就在这个方面做出了尝试。
研究人员利用英国生物银行45万人的数据，通过鉴定基因序列中具有10％或以上纯合子作为二代以内血亲的判定标准，分析结果显示，共检出125例二代以内近交繁殖的后代，相当于每3650人中就有一人，或发生率为0.03％。
其中，有54人被认为其父母属于一级亲属乱伦。
在外媒的解读中，普遍用这个比例类推到全英国人口，渲染称“英国有13000人是近亲乱伦出生的后代”。
近亲结婚，他的这一个坏处肯定是非常多的，一般情况下进行结婚容易引起一些染色体异常的疾病，对于孩子来说肯定是不好的。
