行政绩效评估程序是指实施行政绩效评估的过程及其所包含的各个阶段。实施具体的行政绩效评估应包括制定计划、初步调查、管理控制评估、详细评估和撰写评估报告五个步骤。 为了有效率地、经济节约地和有效益地实现评估目标，评估人员应当合理地组织绩效评估工作。任何一项评估在正式开展以前，都应当制定切实可行的计划，以助于控制评估全过程，保证评估工作质量。
（1）制定计划的目的
绩效评估的计划工作，主要是为了确定评估目标、范围以及为实现目标而采用的方法。评估目标是指评估工作所要完成的任务。它包括两个方面的内容，一是评估对象和效益方面的内容；二是评估人员希望开发的潜在的评估成果和报告要素。评估范围是评估工作的界限，即空间和时间的界定。如对被评估对象的期间界定、地点界定以及数量界定等。评估方法主要包括为实现评估目标而采用的检查与收集信息的方法，即资料收集方法与分析方法。评估方法不仅包括评估人员所采用程序的性质，而且还包括程序的范围(为样本数量)。
（2） 计划的具体内容
在进行具体评估工作以前，应根据接受的评估任务事先编制评估计划及评估提纲，对评估工作的每个阶段提出按照评估目标收集资料和信息的计划，以及为完成计划而提出的具体程序和方法。绩效评估计划应确定下列具体事项：
首先，完成该项评估任务所需的专业人员类别和人数。
其次，为了确定评估目标，评估人员应收集哪些方面的资料，以及如何收集和评价。
再次，为了证实评估目标，得出与目标相关的客观结论，评估人员必须搜集哪些方面的证据，需要搜集多少证据，搜集证据时需要采取哪些手段。
最后，评估报告中应该反映评估人员预期取得的结果。
（3） 书面计划
制定评估计划应以书面形式表达。书面计划的形式和内容因评估的不同而异。评估计划应包括评估方案或备忘录或其他适当形式的文件，这些文件应记录关于评估目标、范围和方法的重要决策以及评估人员作出决策的依据。 （1） 详细评估的目的
在初步调查和管理控制评估阶段，就已经明确了详细评估的目标、范围和方法。具体地说，详细评估阶段的审查目的，一是验证以前所获取信息的有效性；二是为了证实评估目标而收集充分、可靠和相关的信息，为评估成果和评估结论提供一个合理的基础。
（2） 详细审查的内容
审计人员必须通过对人员、财产或事项的直接检查或观察以取得实物信息，这类信息可以以备忘录、照片、图画、图表、地图或实物样本的形式形成文件。评估人员必须通过审阅、复查、核对、收集、复制、摘录等方法以取得文件信息，如信件、合同、法规原文、会计记录、发票等人为形成的信息。评估人员还必须通过整理、汇总、计算、比较、分析、推理等手段以取得分析性信息。详细审查阶段搜集的信息应该是充分的、可靠的和相关的。
在取得这些充分、可靠和相关的信息的基础上，评估人员通过预先设计的评估模型或方法，对评估对象进行某一方面或者整体性的分析。如在成本-效益分析中，评估人员需要详细罗列全部的成本要素，包括内部的、外部的、直接的、间接的，如果出现遗漏就会使整个评估出现失误。如果有必要，也可以对两个或者更多的同类行政组织进行行政绩效的比较评估。如以某一个组织为参照物，运用对比的办法比较其与被评估组织的工作成本、效益和净收益。这种评估在标杆管理中得到广泛运用。 详细评估以后，评估人员应该拟订书面报告，传达每一项评估结果。撰写评估报告的目的，是将评估结果变成第三方可以接受和理解的形式，以及减少结果被误解的可能，并使结果可以接受公众的检查。绩效评估报告的内容是：评估目标、范围和方法；评估结果；评估建议；评估遵循的准则；重大不合规现象和滥用行为；违法行为；管理控制重大缺陷；被评估项目负责人对评估人员的发现、结论、建议和打算采取的纠正措施所表示的看法；评估人员确认的重大管理成就；向未来评估人提出的建议；报告未披露资料的性质以及必须不予披露的要求等。绩效评估报告应该完整、准确、客观和有说服力，并在业务事项允许的情况下尽可能地清楚、明确。评估报告应该及时发出，使管理部门及其他有关团体都能够及时地利用信息。如果一份报告提出太晚，即使它是精心拟订的，对于决策者来说也是没有什么价值的。
行政绩效评估是对政府部门的工作绩效进行评估的过程，是一种重要的管理工具。一般来说，行政绩效评估包括以下程序：
确定评估目标和标准：行政绩效评估需要明确评估的目标和评估标准。评估目标可以包括提高政府绩效、优化政府服务、提高政府效率等。评估标准可以包括政府工作指标、政策实施效果、公众满意度等。
收集评估信息：行政绩效评估需要收集相关的评估信息，包括政府工作报告、政策文件、统计数据、调查问卷等。评估信息的收集需要全面、客观、准确、可靠。
分析评估信息：收集到的评估信息需要进行分析和综合，评估政府工作的绩效表现和问题瓶颈。分析过程需要结合评估目标和标准，确定政府工作的优点和需要改进的方面。
评估结果反馈：评估结果需要及时反馈给政府部门，包括评估报告、评估数据和评估结论等。反馈过程需要与政府部门进行沟通，明确改进方向和措施。
改进和应用：评估结果需要作为改进和优化政府工作的依据，制定改进措施和行动计划。政府部门需要根据评估结果，积极推进工作改进，提高政府工作效率和服务质量。