核定征收企业所得税与查账征收企业所得税的计税依据、汇算清缴、申报表、所得税率不同。
1、计税依据不同：计税依据是查账征收与核定征收最大的区别，查账征收是以所得税额为计税依据的，可以简单的说是以利润为计税依据。核定征收是以收入乘以征定率得出的所得税额为计税依据。征定率一般系所属辖区的税务专管员及税务部门核定税率。
2、汇算清缴不同：查账征收的汇算清缴比较复杂，需要根据税法计算各种费用的扣除标准，以及提出超额的费用进行纳税调整。核定征收相对比较简单，只需算准收入即可。
3、申报表不同：查账征收的申报表是a类报表，核定征收的申报表是b类报表。
4、所得税率不同：查账征收一般税率是25%，高新技术企业优惠税率为15%，其他部分优惠税率为20%、10%。核定征收采用征定率，征定率一般系所属辖区的税务专管员及税务部门核定税率。