南通站和南通西站的区别是：地理位置不同、车次安排不同、车站定位不同、建设意义不同等。南通站位于中国江苏省南通市崇川区永兴大道，是宁启铁路的中间站。南通西站位于中国江苏省南通市通州区。
南通西站简介
南通西站，是中国铁路上海局集团有限公司管内铁路车站，也是沪苏通铁路、盐通高速铁路、通苏嘉甬高速铁路的交汇车站。
截至2020年6月，南通西站总建筑面积约1.6万平方米。候车大厅约8000平米，可容纳1000人同时候车。
截至2020年12月，南通西站站场规模为4台8线，中间4条为沪苏通铁路，两侧4条为盐通高速铁路及通苏嘉甬高速铁路。