第85集
箫剑带晴儿离开，但经晴儿劝说又复归队。黎大人回京报告几人伤势，呈上在四合院发现的药方和诗，并询问皇上派有几路人马。箫剑带众人来到贺家，永琪见正在练武的箫剑和小燕子亲密接触，醋意引发冲突升级。箫剑情急之下，竟坦白小燕子是其亲生妹妹，并述说他们本姓萧，父亲被人追杀，母亲殉情。皇上将紫薇舅公舅婆带至慈宁宫，他们当面招认曾受蒲公公指使作伪。
第86集
原来皇上从十二阿哥处已获知皇后举动，认为是她在派人追杀小燕子等。皇后默口难辩，皇上声称将会算账，太后亦后悔伤心。小燕子问起仇人之事，箫剑淡然回避。班杰明借用白鹅展开别样表演，庆祝兄妹团圆。晴儿认为“杀父仇人”和大家有关，并猜到了一个答案。众人为生计又开起面馆，小燕子正为食客表演，柳青柳红金琐突然在人群中捧场。“十全十美”全员到齐。
第87集
班杰明对众人出双入对感到失落，小燕子见状，编造事由安排班杰明和柳红在山上谋面，竟想要撮合他们。二人在山头发觉被骗，揪出了躲在一旁的小燕子。小燕子却误以为班杰明害羞，继续谋划，又将二人关进一间屋中，这次惹怒了二人。班杰明冲小燕子浇了一桶水，阐明当前心声。柳红发表了一场“不靠男人”的演说，一位食客闻听大声叫好。原来此人是高亮双胞胎弟弟高明。
第88集
正当众人在面馆门口卖艺时，福伦率领一群便衣侍卫终于找到了尔康等人，福伦转达了皇上的赦免之意，并要求众人回宫，但是却被婉拒。而另一方面，众人也不禁怀疑那一批下手狠毒的杀手或许是皇后所派。乾隆得知尔康等人意志坚决不肯回宫后，忧心不已。“罗员外”包了面馆，小燕子为了给“罗员外”惊喜，借来大头面具为“罗员外”表演了一场精彩的节目。原来“罗员外”竟是微服出宫亲自来到南阳的乾隆！
第89集
父子们经过惊滔骇浪的冲击后想不到尚有机会相见，尤其地位卓伟的一国之君竟会为挽回子女们真挚的亲情之爱而亲临外地，这对众人而言都是极大的震撼！四大才子与两大美女的到来让众人惊喜不已，郎世宁和常寿也赶来与众人见面。此时唯有箫剑的心情与众人不同。乾隆皇下了一番工夫欲迎回小燕子等人回宫，可惜众人对皇宫里的倾轧迫害仍是余悸犹存。他们执意去大理开创一个全新的生活。
第90集
永琪看过信后矛盾不已，小燕子很想帮他分担。小燕子带箫剑见皇上，箫剑却冷眼以对，并拒绝受官和回京结婚。皇上安排才子美女倾情献唱劝几人回宫，箫剑十分气愤，并和永琪在相互不解中又发冲突。临别前皇上赠予紫薇小燕子“金牌令箭”，紫薇终于决定暂时放弃南下而回宫。箫剑冲上前将小燕子带至郊外，宣称乾隆即是杀父仇人，并称当年抄家前夜母亲曾告诉他妹妹的胎记。
第91集
紫薇证实了小燕子的胎记。小燕子在重创之下推开永琪紫薇，称是仇家。她飞马奔回，竟挥着鞭子攻击皇上，箫剑出面阻拦。箫剑直言父亲系被诬为青龙帮而斩首，皇上与福伦均不记得此事。皇上要查明真相，刑部、大理寺却均无当年“乱党”事件记录。小燕子整日不言不语却不停地干活，终于倒下。皇上来看望小燕子，表示无论案情如何也绝不会牵连于她，并又喂她喝药。
第92集
皇上的诚意打动了小燕子，她终于恢复正常。福伦、傅恒调查案件获得突破，原来当年的浙江巡抚玛钰为报私仇，以虚名擅自处决了萧之航。皇上在南阳提审玛钰，将其就地正法。大仇得报，箫剑前嫌尽释。永琪提出要小燕子与他一同回宫，但小燕子却仍在考虑，她怕面对欣荣、愉妃和太后。晴儿坚持去往大理，而柳青决定回京。众人在行前为金琐、柳青举行了婚礼，皇上等均出席。
第93集
小燕子对是否回宫十分矛盾。柳红留恋面馆之际，高明突然进门，称柳红前次的语出惊人令其难忘，并询问了柳红的姓名。永琪反复回想信中内容，小燕子也希望他承担责任，二人在痛苦的两难抉择中定下两年之约，暂时分离。班杰明愿意赴大理，永琪托付其照顾小燕子。小燕子与皇上泛舟游湖，作以告别。夜晚的“十全十美”面宴上，小燕子给面条起了各式名字，众人感叹难聚首。
第94集
永琪写出七百三十封信，让小燕子每天打开一封。两路人马相别，小燕子却不肯出现，躲着泪送众人离去。突然，她骑马奔至山头，远望离去的车马。而行进中的柳红突闻身后呼叫，原是高明飞马而来，二人并进。皇上等人回宫，太后表示将尽快定下紫薇名分并完婚。永琪欲留孩子给愉妃欣荣，但想到小燕子便无法实现。他来至漱芳斋睹物思人，并将燕子钟、“出气球”带回永和宫。
第95集
小燕子等终于来至大理，并见过了萧家叔婶。当地众人载歌载舞，小燕子却始终抱着永琪留下的信篮子。尔康、永琪突遇曾追杀自己的太监，当即将其拿下。此人供称追杀正是奉皇后之命，皇上震怒下欲斩皇后和容嬷嬷。紫薇在关键时刻拿出金牌求免二人死罪，并用一首“不打诗”中止了对容嬷嬷的杖刑。皇上令皇后不得跨出景仁宫一步。小燕子决定看完所有的信，乐得她合不拢嘴。
第96集
晴儿和箫剑在洱海以白族风俗举行了婚礼，小燕子班杰明现场献唱。桂嬷嬷给欣荣出主意，让永琪睡前喝下药酒。永琪在意识迷乱中，将欣荣当作小燕子，欣荣接受。小燕子开始练字，给永琪写信。皇上封紫薇为“明珠格格”，并指婚予尔康；太后送来新衣，并送回了福家玉佩。小燕子在放羊时想念永琪，班杰明教她拉小提琴曲“四季”。紫薇跪拜告别皇上、太后等，行将出嫁。
第97集
紫薇向令妃磕头，感谢她多年的照顾。才子美女再次“气儿力顶”，送别紫薇。洞房中，紫薇与尔康以身上的疤痕为引，展开一番追忆与告白。一只山羊离群，小燕子追至山林而迷路。突降大雨，小燕子躲至山洞，又冷又饿又怕。班杰明冒雨赶来，二人顿时相拥。班杰明脱下衣服给小燕子穿，自己着了凉，回家后咳嗽一夜并发烧，小燕子尽心照顾他。欣荣有喜，愉妃十分高兴。
第98集
永琪认为任务已完成一半，孩子将是他留给额娘的希望。班杰明醒来，将趴在床边睡着的小燕子画下。欣荣生下儿子，永琪即向皇上辞行。皇上尊重其选择，并称若他三年未归，将宣告其去世。永琪带着新写的信和燕子钟，在孩子满月之时孤身骑马出宫，尔康和已有身孕的紫薇在半路等候相送。小燕子和永琪在早已超过约定期限的某日终于再相会。班杰明告别箫剑一人，策马离去。
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