桂林市第二人民医院以其特色专科在桂林地区享有盛誉。内分泌科作为糖尿病医疗教育中心，擅长诊治糖尿病及其并发症，包括甲亢、甲状腺疾病等，并在风湿免疫疾病和骨质疏松等方面有丰富的临床经验。
眼科领域，该医院率先引进了白内障超声乳化和人工晶体植入术，角膜移植等技术，成功率高达98.02%，配备了先进的眼科设备，为患者提供高质量的复明服务。
心血管内科在冠心病和心梗塞的诊治上表现出色，尤其在介入治疗方面领先，包括冠脉成形术、支架置入等，设有彩色中央监护系统，提供24小时全面监测。
消化、肾内科在ERCP技术上处于市内前列，能处理十二指肠疾病、胰胆管问题，并应用血透等技术治疗多种重症疾病，如急性中毒和肝炎。
普通外科特色明显，以胸腔镜和腹腔镜手术为主，擅长肿瘤腔镜治疗，如早期乳癌手术，同时在消化道疾病和老年疝气治疗上积累了丰富的经验。
呼吸内科在呼吸支持和睡眠呼吸暂停治疗方面处于市内领先，处理各种呼吸障碍疾病，如睡眠呼吸暂停、尘肺病和COPD等，提供全面的呼吸系统疾病诊疗服务。
桂林市第二人民医院是一所集医疗、预防、保健、教学、科研等功能于一体的三级甲等综合性医院，始建于1916年，拥有副主任、副教授以上职称65人，中级职称284人，在职研究生11人，以心血管内科、消化内科、内分泌内科、呼吸内科、普外科、骨科、眼科、新生儿科、麻醉科、物理诊断科、放射科为优势科室，是全市医院中唯一取得职业健康体检与职业病诊断资格医院。