上海交通大学医学院附属医院附属第九人民医院，其历史可以追溯至1920年的“伯特利医院”。历经多次更名，1952年成为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学的附属医院，2005年更名为现名。这家医院位于繁华的黄浦区，交通便利，临近M8地铁线和中山环路高架，与浦东隔江相望，2010年上海世博会期间更是倍受瞩目。
作为一所集医、教、研于一体的三级甲等综合性教学医院，九院以口腔、整复外科和骨科为特色，具有强大的内、外科实力。医院设有28个临床科室和10个医技部门，拥有1860多名医疗工作人员，其中包括众多副主任医师和副教授。医院的学术阵容强大，拥有三位中国工程院院士，他们在各自领域创造了多项国内“第一”成就。
九院还是上海交通大学口腔医学院和临床医学院的重要基地，设有多个研究所和研究中心，如上海市口腔医学研究所和上海市整复外科研究所等。在这里，曹谊林教授等知名学者在科研领域取得了显著成绩，如“裸鼠背上长人耳”项目等，备受国际关注。
医院在多个医学中心建设中扮演重要角色，如上海市临床口腔医学中心、整复外科临床医学中心和关节外科临床医学中心。口腔医学和整复外科学是教育部重点学科，其中口腔颌面外科、口腔内科、口腔修复科和口腔正畸科分别享有上海市重点学科或特色学科的地位。整复外科和骨科则是国家“211工程”重点学科，且在国内外享有盛誉。
近年来，九院的硬件设施得到显著提升，引进了先进的医疗设备。医院日门诊量接近4000人次，年收治和手术量庞大。同时，作为医学教育的重要基地，九院为各类医学人才提供了丰富的教学资源和科研机会，每年接待500多名进修医生和学生。
九院坚持“科教兴院”，近年来承担大量科研项目，成果丰硕，多项科研成果在全国乃至国际上获得认可。医院的科研贡献对于我国卫生事业的发展具有重要意义。
上海交通大学医学院附属瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所大型综合性教学三级甲等医院。上海交通大学医学院附属新华医院创建于1958年。通过新华人近五十年的励精图治，已成为一所学科门类齐全、具有专业特色，集医、教、研于一体的现代化综合性教学医院。上海交通大学医学院附属仁济医院建于1844年，是上海开埠后第一所西医医院，迄今已有164年的历史。上海交通大学医学院附属胸科医院（上海市胸科医院）是我国最早成立的以诊治心胸疾患为主的三级甲等专科医院。